RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383904.1

RNU6-657P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 657, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-657P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-657P-201ENST00000383904 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-657P-201ENST00000383904 Q0VG73 95 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-657P-201ENST00000383904 PRO1933Q9H354 126 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-657P-201ENST00000383904 ZNF292O60281 2723 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-657P-201ENST00000383904 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-657P-201ENST00000383904 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa0.15□□□□□ -2.38
RNU6-657P-201ENST00000383904 FAM135AQ9P2D6 1515 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 A0A1B0GWA3 101 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 CACNA1AO00555 2505 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 ABCA13Q86UQ4 5058 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 TMEM262E9PQX1 116 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 SPRR1AP35321 89 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 SNCAP37840 140 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 FAM223AQ8IWN6 122 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 SPRR4Q96PI1 79 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 HYDINQ4G0P3 5121 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 MYO7BQ6PIF6 2116 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 I3L2K1 104 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 S100PP25815 95 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 UBE2D3P61077 147 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 UBE2D2P62837 147 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 FDCSPQ8NFU4 85 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 MYOM1P52179 1685 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 CUL7Q14999 1698 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 RYR3Q15413 4870 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 NRKQ7Z2Y5 1582 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 COX6B1P14854 86 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 HSD52Q0P140 79 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 C10orf113Q5VZT2 155 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 PTPN13Q12923 2485 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 PZPP20742 1482 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 CGREF1Q99674 301 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 TCEAL7Q9BRU2 100 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 VAMP8Q9BV40 100 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 USH2AO75445 5202 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 COL7A1Q02388 2944 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 HERC1Q15751 4861 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 USF3Q68DE3 2245 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 HMGXB3Q12766 1538 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 ARHGAP5Q13017 1502 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-657P-201ENST00000383904 SFTA2Q6UW10 78 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 BPTFQ12830 3046 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 LAMC1P11047 1609 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 NDUFC1O43677 76 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 SEC11AP67812 179 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 DEFB123Q8N688 67 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 LINC00846Q9NV44 126 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 PAPPAQ13219 1627 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 SHROOM2Q13796 1616 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 NSD3Q9BZ95 1437 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 TMEM218A2RU14 115 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 FAM223BA6NKX1 122 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 USMG5Q96IX5 58 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 NCOR1O75376 2440 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 STAB1Q9NY15 2570 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 SPINK4O60575 86 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 LINC01600Q96MT4 127 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 COL12A1Q99715 3063 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 BSNQ9UPA5 3926 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 GAPVD1Q14C86 1478 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 HIVEP1P15822 2718 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 hADV29S1A0JD25 119 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 COX8AP10176 69 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 AP4S1Q9Y587 144 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 VWFP04275 2813 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 BTAF1O14981 1849 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-657P-201ENST00000383904 TET3O43151 1660 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 GNGT2O14610 69 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 SPRR1BP22528 89 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 MRC2Q9UBG0 1479 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 LINC00032P0C843 101 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-657P-201ENST00000383904 PMCHL1Q16048 86 aa0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms