RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 Q9UF83 564 aa11.23□□□□□ -0.61
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PTPRU-201ENST00000345512 Q6Q795 121 aa11.21□□□□□ -0.61
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PTPRU-201ENST00000345512 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRU-201ENST00000345512 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRU-201ENST00000345512 FHL2Q14192 279 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRU-201ENST00000345512 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRU-201ENST00000345512 Q8IZM0 81 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRU-201ENST00000345512 LYRM9A8MSI8 78 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRU-201ENST00000345512 J3QKU1 62 aa11□□□□□ -0.65
PTPRU-201ENST00000345512 SHISA2Q6UWI4 295 aa11□□□□□ -0.65
PTPRU-201ENST00000345512 WFDC9Q8NEX5 89 aa11□□□□□ -0.65
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