RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rbm7Q9CQT2 265 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Armc1Q9D7A8 282 aa0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rpl7l1Q9D8M4 246 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Stpg4Q9DAG5 247 aa0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tmem38bQ9DAV9 292 aa0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Bin3Q9JI08 253 aa0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rnase4Q9JJH1 148 aa0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Myh7bA2AQP0 1941 aa0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Eml6Q5SQM0 1958 aa0.65□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Trav4-4-dv10A0A075B651 110 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A930009A15RikG3UYI6 118 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm20834J3QM72 227 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defa37K9J724 93 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10267M0QWD8 85 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prrt1O35449 306 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sigmar1O55242 223 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sprr2jO70561 109 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 P01636 108 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 P01837 106 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 ChrngP04760 519 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sdc2P43407 202 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Clec10aP49300 304 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cav1P49817 178 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defa-rs12P50716 91 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vgll3P85442 326 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 S100gP97816 79 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm826Q3UQ74 109 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ift20Q61025 132 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ppp1r14bQ62084 147 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr965Q7TRA7 312 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr917Q7TRC3 309 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr745Q7TRL9 328 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam210aQ8BGY7 273 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slamf7Q8BHK6 333 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fbxw21Q8BI38 468 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cbln4Q8BME9 198 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr508Q8VG42 310 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr1257Q8VGP0 309 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Brk1Q91VR8 75 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Plekhj1Q9D240 164 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nos1apQ9D3A8 503 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ccl8Q9Z121 97 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Scn9aQ62205 1984 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm9195A0A140LHT4 2805 aa0.64□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Flg2Q2VIS4 2362 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm28778A0A087WSK7 233 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mup8E9PVW0 235 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10269G3UWD7 123 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10338K7N692 204 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Serpini1O35684 410 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Bglap3P54615 95 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tac3P55099 116 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ube2bP63147 152 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ctf2P83714 204 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rpl19P84099 196 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rspo3Q2TJ95 277 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Arl14eplQ3UKZ7 152 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm4952Q5FW57 296 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Trp53rkaQ5U452 244 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lyrm2Q8R033 88 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nup35Q8R4R6 325 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tmem123Q91Z22 195 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cotl1Q9CQI6 142 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Atg12Q9CQY1 141 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tspo2Q9CRZ8 162 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 1700008P02RikQ9DAJ8 175 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ssr3Q9DCF9 185 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hmgn5Q9JL35 406 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cd164Q9R0L9 197 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Asb4Q9WV71 426 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ppp1r17Q9Z2E4 159 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cacna1eQ61290 2272 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Apc2Q9Z1K7 2274 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nid2O88322 1403 aa0.63□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cacna1cQ01815 2139 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 DscamQ9ERC8 2013 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tcrg-C2A0A075B5Z2 167 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm13539A0A1B0GSM6 183 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Esp22A8R0V4 111 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm45062E0CZ38 131 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm3020E9Q3J7 150 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm20873J3QMQ9 232 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm21812J3QN84 227 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tnfaip6O08859 275 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 P01853 167 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hbb-b2P02089 147 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Csf3P09920 208 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CapzbP47757 277 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fkbp14P59024 211 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vbp1P61759 196 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 KncnQ307W7 124 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tmem69Q3KQJ0 245 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm9Q3UKW5 162 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Clvs2Q8BG92 327 aa0.62□□□□□ -2.31
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10190Q8BSD7 107 aa0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.8 ms