Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Cacna1eQ61290 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cacna1eQ61290 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cacna1eQ61290 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Cacna1eQ61290 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Cacna1eQ61290 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Cacna1eQ61290 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cacna1eQ61290 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cacna1eQ61290 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cacna1eQ61290 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cacna1eQ61290 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cacna1eQ61290 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Cacna1eQ61290 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cacna1eQ61290 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Cacna1eQ61290 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cacna1eQ61290 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cacna1eQ61290 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cacna1eQ61290 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cacna1eQ61290 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cacna1eQ61290 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cacna1eQ61290 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cacna1eQ61290 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cacna1eQ61290 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Cacna1eQ61290 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cacna1eQ61290 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cacna1eQ61290 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cacna1eQ61290 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cacna1eQ61290 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cacna1eQ61290 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Cacna1eQ61290 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cacna1eQ61290 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cacna1eQ61290 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Cacna1eQ61290 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cacna1eQ61290 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cacna1eQ61290 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cacna1eQ61290 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cacna1eQ61290 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cacna1eQ61290 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cacna1eQ61290 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cacna1eQ61290 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cacna1eQ61290 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cacna1eQ61290 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Cacna1eQ61290 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cacna1eQ61290 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Cacna1eQ61290 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cacna1eQ61290 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cacna1eQ61290 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cacna1eQ61290 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cacna1eQ61290 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacna1eQ61290 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacna1eQ61290 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cacna1eQ61290 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cacna1eQ61290 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cacna1eQ61290 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna1eQ61290 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna1eQ61290 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacna1eQ61290 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cacna1eQ61290 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cacna1eQ61290 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacna1eQ61290 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna1eQ61290 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna1eQ61290 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cacna1eQ61290 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacna1eQ61290 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacna1eQ61290 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cacna1eQ61290 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cacna1eQ61290 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cacna1eQ61290 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacna1eQ61290 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cacna1eQ61290 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cacna1eQ61290 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna1eQ61290 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cacna1eQ61290 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacna1eQ61290 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cacna1eQ61290 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cacna1eQ61290 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cacna1eQ61290 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cacna1eQ61290 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cacna1eQ61290 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cacna1eQ61290 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cacna1eQ61290 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna1eQ61290 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cacna1eQ61290 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cacna1eQ61290 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cacna1eQ61290 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cacna1eQ61290 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna1eQ61290 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna1eQ61290 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1eQ61290 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1eQ61290 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna1eQ61290 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cacna1eQ61290 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacna1eQ61290 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna1eQ61290 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna1eQ61290 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cacna1eQ61290 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cacna1eQ61290 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cacna1eQ61290 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cacna1eQ61290 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cacna1eQ61290 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms