Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cav1P49817 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Cav1P49817 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cav1P49817 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cav1P49817 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Cav1P49817 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cav1P49817 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cav1P49817 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cav1P49817 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cav1P49817 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cav1P49817 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cav1P49817 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cav1P49817 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cav1P49817 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cav1P49817 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cav1P49817 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Cav1P49817 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Cav1P49817 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cav1P49817 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cav1P49817 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cav1P49817 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Cav1P49817 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cav1P49817 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cav1P49817 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cav1P49817 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cav1P49817 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cav1P49817 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cav1P49817 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Cav1P49817 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cav1P49817 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cav1P49817 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cav1P49817 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cav1P49817 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cav1P49817 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cav1P49817 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cav1P49817 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cav1P49817 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cav1P49817 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Cav1P49817 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cav1P49817 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cav1P49817 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cav1P49817 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cav1P49817 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cav1P49817 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cav1P49817 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cav1P49817 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cav1P49817 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cav1P49817 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cav1P49817 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cav1P49817 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cav1P49817 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cav1P49817 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cav1P49817 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cav1P49817 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cav1P49817 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cav1P49817 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cav1P49817 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cav1P49817 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cav1P49817 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cav1P49817 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cav1P49817 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cav1P49817 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cav1P49817 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cav1P49817 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cav1P49817 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cav1P49817 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cav1P49817 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cav1P49817 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cav1P49817 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cav1P49817 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cav1P49817 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cav1P49817 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cav1P49817 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cav1P49817 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cav1P49817 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cav1P49817 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cav1P49817 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cav1P49817 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cav1P49817 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cav1P49817 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cav1P49817 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cav1P49817 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cav1P49817 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cav1P49817 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cav1P49817 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cav1P49817 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cav1P49817 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cav1P49817 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cav1P49817 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cav1P49817 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cav1P49817 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cav1P49817 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cav1P49817 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cav1P49817 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cav1P49817 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cav1P49817 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cav1P49817 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cav1P49817 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cav1P49817 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cav1P49817 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms