Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Cav1P49817 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Cav1P49817 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Cav1P49817 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Cav1P49817 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Cav1P49817 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cav1P49817 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cav1P49817 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Cav1P49817 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Cav1P49817 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Cav1P49817 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Cav1P49817 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Cav1P49817 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Cav1P49817 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Cav1P49817 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Cav1P49817 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,54■■■□□ 2,64
Cav1P49817 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Cav1P49817 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Cav1P49817 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Cav1P49817 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Cav1P49817 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31■■■□□ 2,55
Cav1P49817 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cav1P49817 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Cav1P49817 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Cav1P49817 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Cav1P49817 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cav1P49817 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cav1P49817 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,5■■■□□ 2,47
Cav1P49817 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Cav1P49817 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Cav1P49817 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Cav1P49817 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Cav1P49817 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Cav1P49817 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cav1P49817 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Cav1P49817 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Cav1P49817 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cav1P49817 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Cav1P49817 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Cav1P49817 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Cav1P49817 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Cav1P49817 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Cav1P49817 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cav1P49817 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cav1P49817 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cav1P49817 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Cav1P49817 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Cav1P49817 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cav1P49817 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cav1P49817 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cav1P49817 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cav1P49817 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Cav1P49817 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Cav1P49817 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cav1P49817 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cav1P49817 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cav1P49817 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cav1P49817 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cav1P49817 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cav1P49817 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cav1P49817 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Cav1P49817 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cav1P49817 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cav1P49817 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cav1P49817 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cav1P49817 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Cav1P49817 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cav1P49817 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cav1P49817 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cav1P49817 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Cav1P49817 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cav1P49817 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cav1P49817 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cav1P49817 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cav1P49817 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cav1P49817 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cav1P49817 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cav1P49817 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Cav1P49817 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cav1P49817 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cav1P49817 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cav1P49817 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cav1P49817 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Cav1P49817 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cav1P49817 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cav1P49817 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cav1P49817 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cav1P49817 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cav1P49817 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cav1P49817 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cav1P49817 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Cav1P49817 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cav1P49817 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cav1P49817 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cav1P49817 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cav1P49817 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cav1P49817 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cav1P49817 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cav1P49817 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cav1P49817 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms