Protein–RNA interactions for Protein: P83714

Ctf2, Cardiotrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf2P83714 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Ctf2P83714 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Ctf2P83714 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Ctf2P83714 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Ctf2P83714 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ctf2P83714 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Ctf2P83714 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ctf2P83714 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Ctf2P83714 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Ctf2P83714 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ctf2P83714 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ctf2P83714 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Ctf2P83714 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ctf2P83714 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Ctf2P83714 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Ctf2P83714 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ctf2P83714 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ctf2P83714 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ctf2P83714 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ctf2P83714 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ctf2P83714 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ctf2P83714 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ctf2P83714 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ctf2P83714 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ctf2P83714 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ctf2P83714 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Ctf2P83714 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ctf2P83714 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ctf2P83714 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ctf2P83714 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ctf2P83714 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Ctf2P83714 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,52■■■□□ 2
Ctf2P83714 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ctf2P83714 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ctf2P83714 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ctf2P83714 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ctf2P83714 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ctf2P83714 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ctf2P83714 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ctf2P83714 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ctf2P83714 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ctf2P83714 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ctf2P83714 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ctf2P83714 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ctf2P83714 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ctf2P83714 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ctf2P83714 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
Ctf2P83714 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ctf2P83714 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ctf2P83714 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ctf2P83714 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ctf2P83714 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ctf2P83714 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Ctf2P83714 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,84
Ctf2P83714 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ctf2P83714 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Ctf2P83714 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
Ctf2P83714 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Ctf2P83714 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ctf2P83714 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ctf2P83714 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ctf2P83714 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ctf2P83714 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ctf2P83714 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ctf2P83714 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ctf2P83714 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ctf2P83714 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ctf2P83714 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ctf2P83714 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Ctf2P83714 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Ctf2P83714 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ctf2P83714 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ctf2P83714 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ctf2P83714 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Ctf2P83714 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ctf2P83714 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ctf2P83714 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ctf2P83714 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ctf2P83714 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ctf2P83714 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ctf2P83714 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ctf2P83714 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Ctf2P83714 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
Ctf2P83714 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ctf2P83714 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ctf2P83714 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Ctf2P83714 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ctf2P83714 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ctf2P83714 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ctf2P83714 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ctf2P83714 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ctf2P83714 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ctf2P83714 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ctf2P83714 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ctf2P83714 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ctf2P83714 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ctf2P83714 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Ctf2P83714 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ctf2P83714 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ctf2P83714 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,4 ms