Protein–RNA interactions for Protein: P83714

Ctf2, Cardiotrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf2P83714 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ctf2P83714 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ctf2P83714 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ctf2P83714 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ctf2P83714 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ctf2P83714 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ctf2P83714 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ctf2P83714 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ctf2P83714 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctf2P83714 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ctf2P83714 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctf2P83714 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ctf2P83714 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ctf2P83714 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ctf2P83714 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ctf2P83714 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctf2P83714 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ctf2P83714 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ctf2P83714 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctf2P83714 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ctf2P83714 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ctf2P83714 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctf2P83714 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ctf2P83714 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ctf2P83714 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ctf2P83714 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ctf2P83714 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ctf2P83714 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ctf2P83714 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ctf2P83714 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ctf2P83714 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ctf2P83714 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ctf2P83714 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctf2P83714 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctf2P83714 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctf2P83714 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctf2P83714 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctf2P83714 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctf2P83714 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctf2P83714 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctf2P83714 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctf2P83714 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctf2P83714 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctf2P83714 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctf2P83714 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctf2P83714 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctf2P83714 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctf2P83714 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctf2P83714 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctf2P83714 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctf2P83714 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctf2P83714 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctf2P83714 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctf2P83714 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ctf2P83714 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctf2P83714 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctf2P83714 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctf2P83714 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctf2P83714 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctf2P83714 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctf2P83714 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctf2P83714 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctf2P83714 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctf2P83714 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctf2P83714 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctf2P83714 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctf2P83714 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctf2P83714 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctf2P83714 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctf2P83714 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctf2P83714 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctf2P83714 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctf2P83714 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctf2P83714 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctf2P83714 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctf2P83714 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctf2P83714 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctf2P83714 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctf2P83714 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctf2P83714 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctf2P83714 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctf2P83714 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctf2P83714 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctf2P83714 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctf2P83714 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctf2P83714 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ctf2P83714 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctf2P83714 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctf2P83714 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctf2P83714 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctf2P83714 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctf2P83714 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctf2P83714 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctf2P83714 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctf2P83714 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctf2P83714 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctf2P83714 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctf2P83714 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctf2P83714 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctf2P83714 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms