Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Rspo3Q2TJ95 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Rspo3Q2TJ95 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Rspo3Q2TJ95 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Rspo3Q2TJ95 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Rspo3Q2TJ95 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Rspo3Q2TJ95 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Rspo3Q2TJ95 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Rspo3Q2TJ95 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rspo3Q2TJ95 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Rspo3Q2TJ95 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Rspo3Q2TJ95 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Rspo3Q2TJ95 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rspo3Q2TJ95 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Rspo3Q2TJ95 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Rspo3Q2TJ95 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rspo3Q2TJ95 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rspo3Q2TJ95 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rspo3Q2TJ95 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Rspo3Q2TJ95 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rspo3Q2TJ95 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Rspo3Q2TJ95 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Rspo3Q2TJ95 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Rspo3Q2TJ95 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Rspo3Q2TJ95 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Rspo3Q2TJ95 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Rspo3Q2TJ95 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Rspo3Q2TJ95 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Rspo3Q2TJ95 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rspo3Q2TJ95 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rspo3Q2TJ95 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Rspo3Q2TJ95 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rspo3Q2TJ95 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,56■■■□□ 2
Rspo3Q2TJ95 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rspo3Q2TJ95 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rspo3Q2TJ95 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rspo3Q2TJ95 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rspo3Q2TJ95 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rspo3Q2TJ95 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Rspo3Q2TJ95 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rspo3Q2TJ95 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rspo3Q2TJ95 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rspo3Q2TJ95 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Rspo3Q2TJ95 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rspo3Q2TJ95 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Rspo3Q2TJ95 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rspo3Q2TJ95 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Rspo3Q2TJ95 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Rspo3Q2TJ95 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,89■■□□□ 1,89
Rspo3Q2TJ95 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rspo3Q2TJ95 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rspo3Q2TJ95 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rspo3Q2TJ95 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rspo3Q2TJ95 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Rspo3Q2TJ95 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Rspo3Q2TJ95 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Rspo3Q2TJ95 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Rspo3Q2TJ95 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rspo3Q2TJ95 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Rspo3Q2TJ95 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,3■■□□□ 1,8
Rspo3Q2TJ95 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rspo3Q2TJ95 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rspo3Q2TJ95 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Rspo3Q2TJ95 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rspo3Q2TJ95 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Rspo3Q2TJ95 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rspo3Q2TJ95 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rspo3Q2TJ95 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rspo3Q2TJ95 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rspo3Q2TJ95 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rspo3Q2TJ95 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rspo3Q2TJ95 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Rspo3Q2TJ95 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rspo3Q2TJ95 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Rspo3Q2TJ95 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Rspo3Q2TJ95 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Rspo3Q2TJ95 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rspo3Q2TJ95 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rspo3Q2TJ95 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rspo3Q2TJ95 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rspo3Q2TJ95 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rspo3Q2TJ95 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rspo3Q2TJ95 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Rspo3Q2TJ95 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Rspo3Q2TJ95 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rspo3Q2TJ95 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rspo3Q2TJ95 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Rspo3Q2TJ95 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rspo3Q2TJ95 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Rspo3Q2TJ95 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rspo3Q2TJ95 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rspo3Q2TJ95 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rspo3Q2TJ95 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rspo3Q2TJ95 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rspo3Q2TJ95 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rspo3Q2TJ95 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rspo3Q2TJ95 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rspo3Q2TJ95 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rspo3Q2TJ95 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rspo3Q2TJ95 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms