Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,88■■■■□ 3,17
Cacna1cQ01815 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Cacna1cQ01815 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cacna1cQ01815 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Cacna1cQ01815 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Cacna1cQ01815 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Cacna1cQ01815 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,31■■■□□ 2,6
Cacna1cQ01815 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Cacna1cQ01815 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31■■■□□ 2,55
Cacna1cQ01815 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Cacna1cQ01815 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,64■■■□□ 2,49
Cacna1cQ01815 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Cacna1cQ01815 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Cacna1cQ01815 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Cacna1cQ01815 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Cacna1cQ01815 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Cacna1cQ01815 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Cacna1cQ01815 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cacna1cQ01815 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cacna1cQ01815 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Cacna1cQ01815 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Cacna1cQ01815 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cacna1cQ01815 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cacna1cQ01815 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Cacna1cQ01815 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Cacna1cQ01815 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,32
Cacna1cQ01815 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cacna1cQ01815 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cacna1cQ01815 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cacna1cQ01815 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cacna1cQ01815 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cacna1cQ01815 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cacna1cQ01815 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Cacna1cQ01815 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cacna1cQ01815 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cacna1cQ01815 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cacna1cQ01815 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cacna1cQ01815 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cacna1cQ01815 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cacna1cQ01815 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cacna1cQ01815 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cacna1cQ01815 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cacna1cQ01815 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cacna1cQ01815 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cacna1cQ01815 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Cacna1cQ01815 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cacna1cQ01815 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cacna1cQ01815 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Cacna1cQ01815 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Cacna1cQ01815 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Cacna1cQ01815 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Cacna1cQ01815 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cacna1cQ01815 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Cacna1cQ01815 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cacna1cQ01815 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cacna1cQ01815 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Cacna1cQ01815 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Cacna1cQ01815 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cacna1cQ01815 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cacna1cQ01815 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cacna1cQ01815 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Cacna1cQ01815 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cacna1cQ01815 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cacna1cQ01815 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cacna1cQ01815 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Cacna1cQ01815 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cacna1cQ01815 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Cacna1cQ01815 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Cacna1cQ01815 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Cacna1cQ01815 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Cacna1cQ01815 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Cacna1cQ01815 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Cacna1cQ01815 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Cacna1cQ01815 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cacna1cQ01815 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cacna1cQ01815 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Cacna1cQ01815 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Cacna1cQ01815 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cacna1cQ01815 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cacna1cQ01815 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Cacna1cQ01815 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cacna1cQ01815 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cacna1cQ01815 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cacna1cQ01815 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cacna1cQ01815 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cacna1cQ01815 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Cacna1cQ01815 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Cacna1cQ01815 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cacna1cQ01815 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Cacna1cQ01815 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Cacna1cQ01815 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cacna1cQ01815 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cacna1cQ01815 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cacna1cQ01815 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cacna1cQ01815 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cacna1cQ01815 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cacna1cQ01815 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Cacna1cQ01815 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Cacna1cQ01815 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cacna1cQ01815 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57,1 ms