RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRSS1P07477 247 aa9.66□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SMIM17P0DL12 118 aa9.66□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SSTP61278 116 aa9.66□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CACNG7P62955 275 aa9.66□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.66□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.66□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 F2Z2F3 143 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CRPP02741 224 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HBBP68871 147 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUP35Q8NFH5 326 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CNFNQ9BYD5 112 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HIGD1CA8MV81 97 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GAGE6Q13070 117 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A1B0GUV1 79 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 H7C1H1 209 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAB4AP20338 218 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FABP4P15090 132 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NTF3P20783 257 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CTRLP40313 264 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PYY3Q5JQD4 70 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BORCS7Q96B45 105 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TPPP3Q9BW30 176 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 J3QL48 77 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 APCSP02743 223 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MGPP08493 103 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RIGQ13278 110 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NIT2Q9NQR4 276 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A1B0GUT8 65 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 REG3AQ06141 175 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PANO1I0J062 215 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM243Q9BU79 118 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PMCHP20382 165 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BAGE3Q86Y29 109 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GTSF1Q8WW33 167 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OXTP01178 125 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLPIP03973 132 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TSTD3H0UI37 97 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SERF1AO75920 110 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TWIST1Q15672 202 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC00310P59036 64 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 COTL1Q14019 142 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PPBPP02775 128 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AMTP48728 403 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 hDV102S1A0JD36 115 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NCR2O95944 276 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C15orf56Q8N910 161 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 H7C423 109 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HSBP1O75506 76 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CAMPP49913 170 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UBE2L6O14933 153 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RNF185Q96GF1 192 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PMCHL1Q16048 86 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TNXBP22105 4242 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C20orf202A1L168 122 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GAS8-AS1O95177 125 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ORMDL3Q8N138 153 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A087WYN8 130 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 249.7 ms