RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.33□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.33□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.33□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 K7EQD1 137 aa6.33□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 LEPROTO15243 131 aa6.33□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.33□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 HIVEP1P15822 2718 aa6.33□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 APOMO95445 188 aa6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 SPINK8P0C7L1 97 aa6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 RRN3P1Q2M238 152 aa6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 C16orf74Q96GX8 76 aa6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.32□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1B0GWB2 263 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 F8W1H4 67 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3-30P01768 117 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 COX6A2Q02221 97 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 ETDBQ3ZM63 59 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.31□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 UBE2D3P61077 147 aa6.3□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 UBE2D2P62837 147 aa6.3□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 CRLF1O75462 422 aa6.3□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 UBE2D1P51668 147 aa6.3□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 SIGMAR1Q99720 223 aa6.3□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.3□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB130BP0DP73 79 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB130AP0DP74 79 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 CRYBA4P53673 196 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 A0A0J9YXY3 114 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 J3QR89 54 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 CFC1BP0CG36 223 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 CFC1P0CG37 223 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 SCGB1A1P11684 91 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 CIDEAO60543 219 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 TSPAN13O95857 204 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 PRO0461Q9UI25 63 aa6.29□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 A6NJY4 79 aa6.28□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.28□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 SPATA25Q9BR10 227 aa6.28□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 A4D1N5 150 aa6.28□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 ATRQ13535 2644 aa6.28□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 FHL2Q14192 279 aa6.28□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.28□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.28□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.28□□□□□ -1.4
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB4AO15263 64 aa6.27□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 NPC2P61916 151 aa6.27□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.27□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.27□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.27□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 LITAFQ99732 161 aa6.27□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.26□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM101Q96IK0 257 aa6.26□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.26□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 X6R8D5 127 aa6.26□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 H7C2G1 150 aa6.26□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 PRSS2P07478 247 aa6.26□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 DAND5Q8N907 189 aa6.26□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.25□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 TIRAPP58753 221 aa6.25□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 GAGE6Q13070 117 aa6.25□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM243Q9BU79 118 aa6.25□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 UBE2L6O14933 153 aa6.25□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.25□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.24□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 PSMB2P49721 201 aa6.24□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB135Q30KP9 77 aa6.24□□□□□ -1.41
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