RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.34□□□□□ -0.27
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE2D2P62837 147 aa13.34□□□□□ -0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.33□□□□□ -0.27
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAGE13Q4V321 117 aa13.32□□□□□ -0.28
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.22□□□□□ -0.29
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.2□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFB130BP0DP73 79 aa13.2□□□□□ -0.3
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRO1854Q9UHT4 67 aa13.2□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYRM7Q5U5X0 104 aa13.19□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTURNQ8N3F0 131 aa13.19□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.19□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.19□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.19□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa13.18□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H7C423 109 aa13.18□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFTA2Q6UW10 78 aa13.18□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMIM9A6NGZ8 99 aa13.17□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMB2P49721 201 aa13.17□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.17□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPANXDQ9BXN6 97 aa13.17□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPANXCQ9NY87 97 aa13.17□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0B4J2C4 111 aa13.17□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFA1O15239 70 aa13.16□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa13.16□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.16□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
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