RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377075.2

CNNM4-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM4, Length 4,800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4-201ENST00000377075 CFAP126Q5VTH2 177 aa15.23■□□□□ 0.03
CNNM4-201ENST00000377075 SPANXCQ9NY87 97 aa15.23■□□□□ 0.03
CNNM4-201ENST00000377075 NDUFA1O15239 70 aa15.23■□□□□ 0.03
CNNM4-201ENST00000377075 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CNNM4-201ENST00000377075 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.22■□□□□ 0.03
CNNM4-201ENST00000377075 CNFNQ9BYD5 112 aa15.22■□□□□ 0.03
CNNM4-201ENST00000377075 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.21■□□□□ 0.03
CNNM4-201ENST00000377075 LINC00643Q86TS7 51 aa15.21■□□□□ 0.03
CNNM4-201ENST00000377075 KLLNB2CW77 178 aa15.2■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 TSHBP01222 138 aa15.2■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.2■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 CXCL5P42830 114 aa15.2■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 PSMB8P28062 276 aa15.19■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.19■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 CRYGDP07320 174 aa15.19■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 INSL3P51460 131 aa15.18■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 POLQO75417 2590 aa15.18■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.18■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 NREPQ16612 68 aa15.17■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 ZMAT4Q9H898 229 aa15.17■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 PRORYQ9H606 182 aa15.17■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa15.16■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.15■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 DIRC1Q969H9 104 aa15.15■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.15■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 SLPIP03973 132 aa15.15■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 Q6ZSV7 163 aa15.15■□□□□ 0.02
CNNM4-201ENST00000377075 DCANP1Q8TF63 244 aa15.14■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa15.14■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 F8W735 103 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 TIRAPP58753 221 aa15.13■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.13■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 EDN2P20800 178 aa15.13■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 A0A096LNJ9 63 aa15.12■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 CCL18P55774 89 aa15.12■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.12■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 REG3AQ06141 175 aa15.12■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 C9orf85Q96MD7 179 aa15.11■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 SDIM1Q6ZPB5 146 aa15.11■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 IGLV1-40P01703 118 aa15.1■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa15.1■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 AVPP01185 164 aa15.1■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 IGIPA6NJ69 53 aa15.09■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.09■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 ZNF702PQ9H963 129 aa15.08■□□□□ 0.01
CNNM4-201ENST00000377075 WFDC10AQ9H1F0 79 aa15.08■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.07■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 TMEM258P61165 79 aa15.06■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.06■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa15.06■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.06■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.06■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 A0A1W2PPR1 153 aa15.06■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 POM121L12Q8N7R1 296 aa15.06■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 XGP55808 180 aa15.05■□□□□ 0
CNNM4-201ENST00000377075 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa15.05■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 COX7BP24311 80 aa15.05■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 J3KT08 172 aa15.05■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 XAGE1AQ9HD64 81 aa15.05■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.04■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 AGRNO00468 2067 aa15.03■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15.03■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 ZNF462Q96JM2 2506 aa15.03■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 NDUFS5O43920 106 aa15.03■□□□□ -0
CNNM4-201ENST00000377075 LST1O00453 97 aa15.01□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa15.01□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.01□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 C6orf99Q4VX62 202 aa15.01□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 H3BQ85 93 aa15.01□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 H7C423 109 aa15□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 C20orf197Q8N268 126 aa15□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 TIMM17BO60830 172 aa15□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 SPATA25Q9BR10 227 aa15□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 LINC00526Q96FQ7 95 aa15□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 ACANP16112 2415 aa14.99□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 UPK3BQ9BT76 320 aa14.99□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 UBE2D1P51668 147 aa14.99□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.99□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 NDUFA7O95182 113 aa14.99□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 PDE6GP18545 87 aa14.98□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.98□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 LYRM9A8MSI8 78 aa14.98□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.97□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.97□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 UQCRQO14949 82 aa14.97□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 SCXQ7RTU7 201 aa14.96□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 LINC01006Q8NI28 216 aa14.96□□□□□ -0.01
CNNM4-201ENST00000377075 ENHOQ6UWT2 76 aa14.95□□□□□ -0.02
CNNM4-201ENST00000377075 ZNF580Q9UK33 172 aa14.95□□□□□ -0.02
CNNM4-201ENST00000377075 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.95□□□□□ -0.02
CNNM4-201ENST00000377075 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 347.8 ms