RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 NREPQ16612 68 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 H7C423 109 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 NFE4Q86UQ8 179 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 CLEC2BQ92478 149 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 FOXI1Q12951 378 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 INAFM1C9JVW0 142 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 M0QY20 66 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 UBE2AP49459 152 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 IL17DQ8TAD2 202 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFB1O75438 58 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 REG3AQ06141 175 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 G3V4G9 280 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFS5O43920 106 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 PDE6GP18545 87 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 Q6ZS46 218 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF702PQ9H963 129 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 RBX1P62877 108 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 U3KQK5 164 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 MIFP14174 115 aa9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 RNF185Q96GF1 192 aa9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 ATOX1O00244 68 aa9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 B5MCH6 92 aa9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 C14orf177Q52M58 125 aa9□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 COX7BP24311 80 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00310P59036 64 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 ADAMTS20P59510 1910 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 IGLV1-40P01703 118 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 LINC01006Q8NI28 216 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM223A0PJW6 202 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 KLLNB2CW77 178 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 A0A1B0GX51 115 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM258P61165 79 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 AVPP01185 164 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 PTH2Q96A98 100 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 TCL1BO95988 128 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 MP68P56378 58 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 HILS1P60008 231 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 SPATA25Q9BR10 227 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 PRR9Q5T870 116 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 GAS8-AS1O95177 125 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 LY6G6DO95868 133 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 NRACQ8N912 160 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 PROK1P58294 105 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00643Q86TS7 51 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 Q8N976 141 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 CRYGDP07320 174 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 DCANP1Q8TF63 244 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 C9orf85Q96MD7 179 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 CNFNQ9BYD5 112 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 B9D2Q9BPU9 175 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 TSHBP01222 138 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 PCSK5Q92824 1860 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms