RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A GPP1P41277 250 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A IRC7P43623 340 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A GPG1P53130 126 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A LSC1P53598 329 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YNL092WP53934 400 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A UME1Q03010 460 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A BI2P03873 423 aa3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A MGM1P32266 881 aa3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A GDA1P32621 518 aa3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A GCS1P35197 352 aa3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A IMD2P38697 523 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YMR124WP39523 943 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A MAF1P41910 395 aa3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A RAD33Q04231 177 aa3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data3.34□□□□□ -1.87not detected
YMR001C-AYMR001C-A PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A AIM44Q99299 758 aa3.34□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A CDC5P32562 705 aa3.33□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A CFD1P40558 293 aa3.32□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A PEF1P53238 335 aa3.32□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YML119WQ03208 357 aa3.32□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A SNU56Q03782 492 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A SNA4Q07549 140 aa3.32□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A NUP145P49687 1317 aa3.32□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YPT1P01123 206 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YEL076C-AP0CX16 216 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YLR464WP0CX17 216 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YCP4P25349 247 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YEL076CP39971 216 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A PMT3P47190 753 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A NUP53Q03790 475 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A MRPL1Q04599 285 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A ENT2Q05785 613 aa3.31□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A GAL4P04386 881 aa3.3□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A SEC12P11655 471 aa3.3□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A MAK32P23060 363 aa3.3□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A COQ3P27680 312 aa3.3□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A MDR1P53258 950 aa3.3□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.3□□□□□ -1.88not detected
YMR001C-AYMR001C-A CRT10Q08226 957 aa3.3□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.3□□□□□ -1.88not detected
YMR001C-AYMR001C-A RTC1Q08281 1341 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A RRP43P25359 394 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A FTH1P38310 465 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A MTG2P38860 518 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A CIN1P40987 1014 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YJR142WP47173 342 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A BUD7Q08754 746 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YOR378WQ08902 515 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A Q0010Q9ZZX9 128 aa3.29□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A AEP2P22136 580 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A AMD2P22580 549 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A ARG1P22768 420 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A ATO2P32907 282 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A SDH8P38345 138 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A STB5P38699 743 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A GND1P38720 489 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A IRC5P43610 853 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A UBP16Q02863 499 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A SRL1Q08673 210 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A YPR027CQ12079 277 aa3.28□□□□□ -1.88
YMR001C-AYMR001C-A CET1O13297 549 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A CWH43P25618 953 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A PEA2P40091 420 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A YIR016WP40572 265 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A YGR237CP50089 785 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A COS12P53053 380 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A NDD1Q08887 554 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A YOR389WQ08912 624 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A PFA4Q12006 378 aa3.27□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A CCT4P39078 528 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A VPS8P39702 1274 aa3.26□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A SAP1P39955 897 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A EAF5P39995 279 aa3.26□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A MDV1P47025 714 aa3.26□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A COG2P53271 262 aa3.26□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A URA3P03962 267 aa3.25□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A YAT2P40017 923 aa3.25□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A MNT2P53059 558 aa3.25□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A YML053CQ04978 212 aa3.25□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A RAD34Q06665 692 aa3.25□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A VPS5Q92331 675 aa3.25□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A CHO2P05374 869 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YMR001C-AYMR001C-A ILS1P09436 1072 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.8 ms