RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	YAR028W	P39548	234 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	SAW1	P39735	261 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	FMP10	P40098	244 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	BNA2	P47125	453 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	JJJ1	P53863	590 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	EOS1	P53938	366 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	VID22	Q05934	901 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	MCP2	Q06567	569 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	FRE6	Q12473	712 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	GRR1	P24814	1151 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	SGF29	P25554	259 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	VPS17	P32913	551 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	ERT1	P38140	529 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	PEX18	P38855	283 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	RTS1	P38903	757 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	STL1	P39932	569 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	BUD16	P39988	312 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	CAF16	P43569	289 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	RAD17	P48581	401 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	YBP2	P53169	641 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	ECM9	Q02202	377 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	YDR131C	Q03899	556 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	ATG33	Q06485	197 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	NSI1	Q12457	570 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	MET17	P06106	444 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	CTT1	P06115	562 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	NUC1	P08466	329 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	MTF2	P10849	440 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	HMG1	P12683	1054 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	SED4	P25365	1065 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	YCL049C	P25577	312 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	HOG1	P32485	435 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	APM3	P38153	483 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	MTG2	P38860	518 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	PNT1	P38969	423 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	MMM1	P41800	426 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	GYP8	P43570	497 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	EPL1	P43572	832 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	SSL2	Q00578	843 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	LCD1	Q04377	747 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	MDM36	Q06820	579 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.53	□□□□□ -1.52	not detected
YMD8	YML038C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	GUP2	Q08929	609 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	NUR1	Q12066	484 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	RTN2	Q12443	393 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YMD8	YML038C	GCN4	P03069	281 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	ARG3	P05150	338 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HSF1	P10961	833 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HOP1	P20050	605 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	STE50	P25344	346 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	COY1	P34237	679 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	MAC1	P35192	417 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	SWH1	P35845	1188 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	OMA1	P36163	345 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	UME6	P39001	836 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	AIM20	P40451	204 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	GYP7	P48365	746 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YPL107W	Q02873	248 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YHM2	Q04013	314 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	PDS5	Q04264	1277 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	GYL1	Q04322	720 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	AIM32	Q04689	311 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YLR345W	Q06137	509 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	MDY2	Q12285	212 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	PHO3	P24031	467 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.51	□□□□□ -1.53	not detected
YMD8	YML038C	MGM1	P32266	881 aa		5.51	□□□□□ -1.53

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