RNA–Protein interactions for RNA: YJL063C

MRPL8, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL8, Length 717 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL8	YJL063C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	GNT1	Q12096	491 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SFI1	Q12369	946 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	PEX11	Q12462	236 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	ESBP6	P53918	673 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	RKM2	Q03942	479 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	APM3	P38153	483 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	LYS9	P38999	446 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	MNT2	P53059	558 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	ORC3	P54790	616 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	ATG10	Q07879	167 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	RIP1	P08067	215 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	ADY2	P25613	283 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	PMT1	P33775	817 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SLD2	P34252	453 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	RAD26	P40352	1085 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	NBP35	P52920	328 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SND1	Q04007	877 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	PUT4	P15380	627 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	CIN8	P27895	1000 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	CWP1	P28319	239 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	ELO1	P39540	310 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SNZ3	P43545	298 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	YJR124C	P47159	448 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SNZ2	P53824	298 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	YDR444W	Q04093	687 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	YDL073W	Q07454	984 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	MTF2	P10849	440 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	BET4	Q00618	327 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	YOR389W	Q08912	624 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	YPL278C	Q08990	100 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SRO7	Q12038	1033 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	RED1	P14291	827 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SEC15	P22224	910 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	MRPL8	P22353	238 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SPT8	P38915	602 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	SNG1	P46950	547 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	HST1	P53685	503 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	YPR114W	Q06107	315 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	YPR078C	Q06813	372 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	TRA1	P38811	3744 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MRPL8	YJL063C	RRN6	P32786	894 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	EXO5	P38289	585 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	TMA108	P40462	946 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	KTR7	P40504	517 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	GLG2	P47011	380 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	PUS2	P53167	370 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	PPN1	Q04119	674 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	THI21	Q08975	551 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	HFA1	P32874	2273 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	ABF1	P14164	731 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	MNE1	P24720	663 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	KAR9	P32526	644 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	TDA3	P38758	523 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	PAN6	P40459	309 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	SPC110	P32380	944 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	ELM1	P32801	640 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	UBS1	P38290	277 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	BDH2	P39713	417 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	INP2	Q03824	705 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	CDC73	Q06697	393 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	YDR061W	Q12298	539 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	BI2	P03873	423 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	YKR104W	P0CE69	306 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	YET1	P35723	206 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	YIL054W	P40524	105 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	SPC105	P53148	917 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	GRX8	Q05926	109 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	SNT1	P25357	1226 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	VAC7	P53950	1165 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.66	□□□□□ -0.54	not detected
MRPL8	YJL063C	CIR2	Q08822	631 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	SKM1	Q12469	655 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	AFI1	Q99222	893 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MRPL8	YJL063C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.4 ms