RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	ADH4	P10127	382 aa		4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TGL1	P34163	548 aa		4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	FLO10	P36170	1169 aa		4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	IMA5	P40884	581 aa		4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	THI6	P41835	540 aa		4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	MRK1	P50873	501 aa		4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	YGL117W	P53133	265 aa		4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	HOS1	Q12214	470 aa		4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	MET5	P47169	1442 aa		4.21	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	VPS15	P22219	1454 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SPO11	P23179	398 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	DSS4	P32601	143 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	PPZ2	P33329	710 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	GSM1	P42950	618 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	CPR8	P53728	308 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	HOF1	Q05080	669 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ARO10	Q06408	635 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.2	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SEC12	P11655	471 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	CBP3	P21560	335 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SAW1	P39735	261 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	PAC2	P39937	518 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ASK10	P48361	1146 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	MET14	Q02196	202 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ARG7	Q04728	441 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TRI1	Q05024	226 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	LTE1	P07866	1435 aa		4.19	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	YMC1	P32331	307 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SDS22	P36047	338 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	CCL1	P37366	393 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	YPT10	P38146	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	STB5	P38699	743 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	PIH1	P38768	344 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SWD1	P39706	426 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SAP4	P53036	818 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
THP2	YHR167W	ARP7	Q12406	477 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.18	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	GAL1	P04385	528 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	YLF2	P38746	405 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	COS12	P53053	380 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	COQ6	P53318	479 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.17	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ATP4	P05626	244 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	LOT5	P34234	306 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	RIM4	P38741	713 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ATF1	P40353	525 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	PIP2	P52960	996 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ACS1	Q01574	713 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TRS31	Q03337	283 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ENT2	Q05785	613 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	MLC2	Q06580	163 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	TGS1	Q12052	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	ULA1	Q12059	462 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SSM4	P40318	1319 aa		4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	SNT2	P53127	1403 aa		4.15	□□□□□ -1.74
THP2	YHR167W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	WHI2	P12611	486 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	PMA2	P19657	947 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	BET2	P20133	325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	VPS34	P22543	875 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	YKL133C	P36066	463 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	TAF5	P38129	798 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	SDH8	P38345	138 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	POL31	P46957	487 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	MAD3	P47074	515 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	YJR008W	P47085	338 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	YNL092W	P53934	400 aa		4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
THP2	YHR167W	MSS18	P08593	268 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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