RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	NMD4	Q12129	218 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	USO1	P25386	1790 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	TPK1	P06244	397 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	GYP6	P32806	458 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	SWH1	P35845	1188 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	YKR075C	P36155	307 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	THI6	P41835	540 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	YJR098C	P47139	656 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	IMA1	P53051	589 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	MNT2	P53059	558 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	MTC3	P53077	123 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	SRT1	Q03175	343 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	TRI1	Q05024	226 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	NBP2	Q12163	236 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	YDR416W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ARG82	P07250	355 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	OM45	P16547	393 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SWC3	P31376	625 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	STB6	P36085	766 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SIF2	P38262	535 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	GIC1	P38785	314 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	UBP9	P39967	754 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YNR071C	P53757	342 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	TOF1	P53840	1238 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	JJJ1	P53863	590 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PRP28	P23394	588 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RIT1	P23796	513 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CLB1	P24868	471 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MIC60	P36112	540 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MRPL16	P38064	232 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	FLR1	P38124	548 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	GPB2	P39717	880 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	FLC2	P39719	783 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	LEM3	P42838	414 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.39	□□□□□ -1.71	not detected
SYF1	YDR416W	RSB1	Q08417	382 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PET123	P17558	318 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MAC1	P35192	417 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SAP190	P36123	1033 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	LYS9	P38999	446 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	BUD16	P39988	312 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	DSD1	P53095	428 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SNF12	P53628	566 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YNR068C	P53754	272 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PHO92	Q06390	306 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	AAD4	Q07747	329 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	THI21	Q08975	551 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RCN2	Q12044	265 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MRP10	O75012	95 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SDH2	P21801	266 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	HSM3	P38348	480 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	BST1	P43571	1029 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	GCV2	P49095	1034 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YAP6	Q03935	383 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	HED1	Q03937	162 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	GIS4	Q04233	774 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	GTB1	Q04924	702 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	BIK1	P11709	440 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PSD1	P39006	500 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	FMP10	P40098	244 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SSU1	P41930	458 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ZIM17	P42844	174 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	UBP15	P50101	1230 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YGR045C	P53229	120 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SPO1	P53541	631 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	HDA1	P53973	706 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MGR3	Q04472	501 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms