RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	SCC4	P40090	624 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	CAB2	P40506	365 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YJL016W	P47072	561 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	URH1	Q04179	340 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	BOP2	Q06150	570 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	DCC1	P25559	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	DOM34	P33309	386 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
DNF2	YDR093W	LAM1	P38851	1228 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PRM9	P39551	298 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	BFA1	P47113	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	VPS70	P47161	811 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	SLX4	Q12098	748 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PTC5	Q12511	572 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	HAP2	P06774	265 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	ATG32	P40458	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YGL138C	P53122	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PHO81	P17442	1178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	FUN30	P31380	1131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YME1	P32795	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YHL050C	P38721	697 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	JHD1	P40034	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	MND1	P53102	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	CUR1	Q06469	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PMT7	Q06644	662 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	DAS2	Q12084	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	MST1	P07236	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	RGR1	P19263	1082 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	IME2	P32581	645 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	SDS22	P36047	338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	RIM2	P38127	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	HSM3	P38348	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	FHL1	P39521	936 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YMR134W	P40207	237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	HUL4	P40985	892 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	AIM23	P47015	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	ALF1	P53904	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PET117	Q02771	107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	TAF12	Q03761	539 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	RGT2	Q12300	763 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	CTR86	P25355	563 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PSY4	P38193	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	SIP4	P46954	829 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	TMA16	Q08687	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	SEC61	P32915	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	VHC1	P38329	1120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	BIT2	P38346	545 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	SWD1	P39706	426 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	HMI1	Q12039	706 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	SEC2	P17065	759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PRP28	P23394	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	HIR1	P32479	840 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PAC11	P40960	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	HXT10	P43581	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	TAF9	Q05027	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	RSF1	Q05043	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	UBX5	Q06682	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	BI4	P03879	638 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	CDC5	P32562	705 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	UBX7	P38349	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	PIB2	P53191	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNF2	YDR093W	SUE1	Q06524	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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