RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	LOT5	P34234	306 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	YPT10	P38146	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	PIH1	P38768	344 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	SPC72	P39723	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	VFA1	P40080	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	SAP4	P53036	818 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	CPR8	P53728	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	RPN13	O13563	156 aa		4.79	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	SIR1	P21691	654 aa		4.79	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	SDH8	P38345	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	MRK1	P50873	501 aa		4.79	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
POP8	YBL018C	TGS1	Q12052	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	CDC5	P32562	705 aa		4.78	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	IDS2	P46958	469 aa		4.78	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	COQ6	P53318	479 aa		4.78	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	GIS1	Q03833	894 aa		4.78	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	WHI2	P12611	486 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	SPO11	P23179	398 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	YCR061W	P25639	631 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	MSH1	P25846	959 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ACA1	P39970	489 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	YNL092W	P53934	400 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	VPS64	Q03944	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ARG7	Q04728	441 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	BNR1	P40450	1375 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	POL3	P15436	1097 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	PHO81	P17442	1178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	PMA2	P19657	947 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	YMC1	P32331	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	PAC2	P39937	518 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	IES5	P40060	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	CIA1	Q05583	330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	AIM6	Q07716	390 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	AAC1	P04710	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	CTT1	P06115	562 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	PPZ2	P33329	710 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	FLO10	P36170	1169 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ARO10	Q06408	635 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	PCL8	Q08966	492 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ICL2	Q12031	575 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ULA1	Q12059	462 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	MSM1	P22438	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	RIT1	P23796	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	YFL015C	P43578	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	AAD3	P25612	363 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	FUI1	P38196	639 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	YBR138C	P38277	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	PUG1	P40100	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	CAB2	P40506	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	IMA1	P53051	589 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	YML119W	Q03208	357 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ATG16	Q03818	150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	CRF1	Q04930	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	CRT10	Q08226	957 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	AMD2	P22580	549 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	DBF20	P32328	564 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	GDA1	P32621	518 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	ERR3	P42222	437 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP8	YBL018C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
POP8	YBL018C	BIK1	P11709	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP8	YBL018C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
POP8	YBL018C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
POP8	YBL018C	VPS8	P39702	1274 aa		4.71	□□□□□ -1.66
POP8	YBL018C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
POP8	YBL018C	WAR1	Q03631	944 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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