RNA–Protein interactions for RNA: Q0060

AI3, Transcript of Endonuclease I-SceIII, yeast

Gene AI3, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI3	Q0060	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	COQ3	P27680	312 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	SFP1	P32432	683 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	YAT2	P40017	923 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
AI3	Q0060	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	GDA1	P32621	518 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	RAD33	Q04231	177 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AI3	Q0060	GAL4	P04386	881 aa		5.08	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	DSS4	P32601	143 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	APM4	Q99186	491 aa		5.07	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	BET2	P20133	325 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	MAK32	P23060	363 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	HXT4	P32467	576 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	DNM1	P54861	757 aa		5.06	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	ADR1	P07248	1323 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	DGR2	P32330	852 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	CDC5	P32562	705 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	YIR016W	P40572	265 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	MDV1	P47025	714 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	THI73	Q07904	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	FTH1	P38310	465 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	ALG12	P53730	551 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	CIN1	P40987	1014 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	YML119W	Q03208	357 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	CRT10	Q08226	957 aa		5.03	□□□□□ -1.6
AI3	Q0060	RTC1	Q08281	1341 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	YCR043C	P25361	127 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	HLJ1	P48353	224 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.02	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	ATP12	P22135	325 aa		5.01	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	YIL152W	P40455	235 aa		5.01	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	PEF1	P53238	335 aa		5.01	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	PFA4	Q12006	378 aa		5.01	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	YOR111W	Q99210	232 aa		5	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	DID4	P36108	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	AMD2	P22580	549 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	MTG2	P38860	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	BOP3	P53958	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	ATX2	Q12067	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
AI3	Q0060	SEC12	P11655	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	SDH8	P38345	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	MNN1	P39106	762 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	NRT1	Q08485	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AI3	Q0060	PPG1	P32838	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	GPG1	P53130	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	RNH70	P53331	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	UBP16	Q02863	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	YOR389W	Q08912	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	UBX3	Q12229	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	DAL3	P32459	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	COG2	P53271	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	RAD34	Q06665	692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	DSE3	Q08729	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	SCO2	P38072	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	VPS8	P39702	1274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	ERV46	P39727	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	CIR1	P42940	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	UME1	Q03010	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	SCW10	Q04951	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	YTA7	P40340	1379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	STB5	P38699	743 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	COS12	P53053	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	MDR1	P53258	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	ARA2	Q04212	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	PHO2	P07269	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	ARG1	P22768	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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