RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 CDC27P30260 824 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 PLCB2Q00722 1185 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 NTRK3Q16288 839 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 STX1AQ16623 288 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 ANO1Q5XXA6 986 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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CLN8-211ENST00000636934 KRT40Q6A162 431 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 ESR2Q92731 530 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 ZNF165P49910 485 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 RTN1Q16799 776 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 JMYQ8N9B5 988 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 SENP2Q9HC62 589 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 CLIC4Q9Y696 253 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 LY75O60449 1722 aa21.49■■□□□ 1.03
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CLN8-211ENST00000636934 INCENPQ9NQS7 918 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 RXRAP19793 462 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 PHKBQ93100 1093 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 ANO10Q9NW15 660 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 CACNA1SQ13698 1873 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 KIF28PB7ZC32 967 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 LUZP1Q86V48 1076 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 NPHP1O15259 732 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 RFC4P35249 363 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 SLC39A14Q15043 492 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 TAF1P21675 1872 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 PPP6R2O75170 966 aa21.46■■□□□ 1.03
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CLN8-211ENST00000636934 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.46■■□□□ 1.03
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CLN8-211ENST00000636934 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 SDF4Q9BRK5 362 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 MYL10Q9BUA6 226 aa21.45■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 DEXIO95424 95 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 ADRA2BP18089 450 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 TERF1P54274 439 aa21.43■■□□□ 1.02
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CLN8-211ENST00000636934 NT5C2P49902 561 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 FANCBQ8NB91 859 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 A0A1B0GVL5 298 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 FGRP09769 529 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 CALM1P0DP23 149 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 CALM2P0DP24 149 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 CALM3P0DP25 149 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 NDUFA8P51970 172 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 SMIM5Q71RC9 77 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 IQCA1Q86XH1 822 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-211ENST00000636934 TNKSO95271 1327 aa21.41■■□□□ 1.02
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