RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		6.7	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		6.7	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		6.7	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		6.7	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	ADH5	P11766	374 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	USP11	P51784	963 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	ATP2B2	Q01814	1243 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	SGO2	Q562F6	1265 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	RAD18	Q9NS91	495 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	GIPC1	O14908	333 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	ECEL1	O95672	775 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	RXRB	P28702	533 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	PLCH2	O75038	1416 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	MAP3K1	Q13233	1512 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	PDE3A	Q14432	1141 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	AOC2	O75106	756 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	GSTT1	P30711	240 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	WDR18	Q9BV38	432 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	KRT82	Q9NSB4	513 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	COL19A1	Q14993	1142 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	NFKBIB	Q15653	356 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	PAOX	Q6QHF9	649 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	DYM	Q7RTS9	669 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	SETDB2	Q96T68	719 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	SPG7	Q9UQ90	795 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TCTN1-222	ENST00000549123	NEO1	Q92859	1461 aa		6.65	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	TIAM1	Q13009	1591 aa		6.65	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	COBL	O75128	1261 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	TGFB1	P01137	390 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	SLFN14	P0C7P3	912 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	LIG1	P18858	919 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	CD97	P48960	835 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	FRMD6	Q96NE9	622 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	KIF14	Q15058	1648 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	PRR19	A6NJB7	356 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	FANCA	O15360	1455 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF862	O60290	1169 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	NME2	P22392	152 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	GRIK1	P39086	918 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	ASPA	P45381	313 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	FGD1	P98174	961 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	MAP7	Q14244	749 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	AKNA	Q7Z591	1439 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	NBPF11	Q86T75	865 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	PDZD3	Q86UT5	571 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	SULF2	Q8IWU5	870 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TCTN1-222	ENST00000549123	CEP44	Q9C0F1	390 aa		6.63	□□□□□ -1.35

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