RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 MBD3O95983 291 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 APOA5Q6Q788 366 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 FBXO41Q8TF61 875 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF3AQ9Y496 699 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 LIFRP42702 1097 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 USP17L12C9JPN9 530 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 USP17L21D6R901 530 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 RESTQ13127 1097 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 RIMBP2O15034 1052 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 RXRAP19793 462 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 GSTO1P78417 241 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 SLX4Q8IY92 1834 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 EVX2Q03828 476 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 MPNDQ8N594 471 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 CPLX1O14810 134 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.644e-8■□□□□ 9.7
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB43O43298 467 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 MICU3Q86XE3 530 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 MYL10Q9BUA6 226 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-204ENST00000412806 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC69A6NI79 296 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 CDC27P30260 824 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT85P78386 507 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ESR2Q92731 530 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 MTA3Q9BTC8 594 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 FGRP09769 529 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 WTAPQ15007 396 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 LDHCP07864 332 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP2D6P10635 497 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 GUCY1B3Q02153 619 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 SBK1Q52WX2 424 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ERICH2A1L162 156 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP4CP60510 307 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 COA1Q9GZY4 146 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 PRDM1O75626 825 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 BAG3O95817 575 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 UBE2HP62256 183 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 NID2Q14112 1375 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 H0YIN7 160 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 PCP11498 1178 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 GTF2IP78347 998 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC6Q86TZ1 520 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 FOCADQ5VW36 1801 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 USP5P45974 858 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF445P59923 1031 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 SEC23AQ15436 765 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 STYK1Q6J9G0 422 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 TNKSO95271 1327 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 USP17L8P0C7I0 530 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 MYH1P12882 1939 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 CHRNA5P30532 468 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 BTDP43251 543 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 NTRK3Q16288 839 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 TMTC2Q8N394 836 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-204ENST00000412806 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms