RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 SNX21Q969T3 373 aa20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 FLT1P17948 1338 aa20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 SHTN1A0MZ66 631 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 SMIM22K7EJ46 135 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 CPA1P15085 419 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 MMP14P50281 582 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEK1Q96PY6 1258 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPDYE6P0CI01 402 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 RUFY3Q7L099 469 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 IL27Q8NEV9 243 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 TTC14Q96N46 770 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF20-201ENST00000316412 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 CYP2D6P10635 497 aa20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 EVX2Q03828 476 aa20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 DLGAP5Q15398 846 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 C12orf60Q5U649 245 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 GPC2Q8N158 579 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 IDI2Q9BXS1 227 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 INCENPQ9NQS7 918 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 RPS6KB1P23443 525 aa20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 NFIAQ12857 509 aa20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 ST18O60284 1047 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 FGRP09769 529 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 MICALL2Q8IY33 904 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 SIPA1L1O43166 1804 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEDD4P46934 1319 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 CACNB3P54284 484 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 PICALMQ13492 652 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 NCOA7Q8NI08 942 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLCD1P51178 756 aa20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYH8P13535 1937 aa20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 WNT10BO00744 389 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 EGFRP00533 1210 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 B4E1Z4 1266 aa20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 AK2P54819 239 aa20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 BECN1Q14457 450 aa20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANTXR2P58335 489 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRDNQ13061 729 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 HSCBQ8IWL3 235 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 KRT23Q9C075 422 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 CLRN2A0PK11 232 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 ORC4O43929 436 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 ENTPD3O75355 529 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms