RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 PSMD14O00487 310 aa22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 USP5P45974 858 aa22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 TEX11Q8IYF3 940 aa22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 NECAB1Q8N987 351 aa22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 PRC1O43663 620 aa22.71■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 CRKP46108 304 aa22.71■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.71■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.71■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 SLF2Q8IX21 1173 aa22.7■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.7■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
DUSP1-201ENST00000239223 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 NIM1KQ8IY84 436 aa22.7■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 TEKT1Q969V4 418 aa22.7■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.7■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.7■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 MYH1P12882 1939 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 APOBRQ0VD83 1088 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 KDM4AO75164 1064 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 PRDM1O75626 825 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 MCM5P33992 734 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 STK3Q13188 491 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 TOMM22Q9NS69 142 aa22.69■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 FLT1P17948 1338 aa22.68■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 TRDNQ13061 729 aa22.68■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.68■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 SENP2Q9HC62 589 aa22.68■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 FGD1P98174 961 aa22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 CXCL9Q07325 125 aa22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 NBR1Q14596 966 aa22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 IL27Q8NEV9 243 aa22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 VPS33BQ9H267 617 aa22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 ANKRD1Q15327 319 aa22.67■■□□□ 1.22
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DUSP1-201ENST00000239223 PICALMQ13492 652 aa22.66■■□□□ 1.22
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DUSP1-201ENST00000239223 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.66■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 GMLQ99445 158 aa22.66■■□□□ 1.22
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DUSP1-201ENST00000239223 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.65■■□□□ 1.22
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DUSP1-201ENST00000239223 PLCG2P16885 1265 aa22.65■■□□□ 1.22
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DUSP1-201ENST00000239223 PKP1Q13835 747 aa22.65■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.64■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.64■■□□□ 1.22
DUSP1-201ENST00000239223 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
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DUSP1-201ENST00000239223 CERS3Q8IU89 383 aa22.64■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.64■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.64■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
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DUSP1-201ENST00000239223 JDP2Q8WYK2 163 aa22.63■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 KRT23Q9C075 422 aa22.63■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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DUSP1-201ENST00000239223 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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DUSP1-201ENST00000239223 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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DUSP1-201ENST00000239223 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.62■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 GTF3C6Q969F1 213 aa22.61■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 LY9Q9HBG7 655 aa22.61■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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