RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 CYP21A2P08686 494 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 ACTN2P35609 894 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 CD151P48509 253 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 SMARCE1Q969G3 411 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 PSME1Q06323 249 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 GRIK3Q13003 919 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 NLRP12P59046 1061 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 E2F4Q16254 413 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 PROSER3Q2NL68 480 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 RINLQ6ZS11 566 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 NID2Q14112 1375 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 BECN2A8MW95 431 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 AK7Q96M32 723 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 USP28Q96RU2 1077 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 TRAF1Q13077 416 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 STOX1Q6ZVD7 989 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.21□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 USP27XA6NNY8 438 aa7.21□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 CBFA2T2O43439 604 aa7.21□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 PAX7P23759 505 aa7.21□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.21□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.21□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 FSIP1Q8NA03 581 aa7.21□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.21□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 CYP27B1O15528 508 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 USP8P40818 1118 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 NCAPHQ15003 741 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 TMTC2Q8N394 836 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 CIAO1O76071 339 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 MAGEA8P43361 318 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 HSPA2P54652 639 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 SLAIN2Q9P270 581 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 DNAI1Q9UI46 699 aa7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 CMA1P23946 247 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 ST5P78524 1137 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 TEX11Q8IYF3 940 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 FAM163BP0C2L3 166 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 RWDD2BP57060 319 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 SH3GL3Q99963 347 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 HPSEQ9Y251 543 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 PPP6R2O75170 966 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 EFCAB8A8MWE9 144 aa7.19□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 PHKG2P15735 406 aa7.19□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 TUBB4BP68371 445 aa7.19□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 DDR1Q08345 913 aa7.19□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 CRYMQ14894 314 aa7.19□□□□□ -1.26
SGIP1-201ENST00000237247 ELF2Q15723 593 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms