RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W UBP9P39967 754 aa7.81□□□□□ -1.16
YKR047WYKR047W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
YKR047WYKR047W YAP5P40574 245 aa7.78□□□□□ -1.16
YKR047WYKR047W ATH1P48016 1211 aa7.78□□□□□ -1.16
YKR047WYKR047W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
YKR047WYKR047W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.77□□□□□ -1.17not detected
YKR047WYKR047W HPC2Q01448 625 aa7.77□□□□□ -1.17
YKR047WYKR047W YDR090CQ03193 310 aa7.77□□□□□ -1.17
YKR047WYKR047W UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
YKR047WYKR047W KIC1P38692 1080 aa7.75□□□□□ -1.17
YKR047WYKR047W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
YKR047WYKR047W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
YKR047WYKR047W GUT1P32190 709 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR047WYKR047W TFB3Q03290 321 aa7.73□□□□□ -1.17
YKR047WYKR047W BRL1P38770 471 aa7.7□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W RAD54P32863 898 aa7.69□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W TGL3P40308 642 aa7.69□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W YGR273CP53329 174 aa7.69□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W KEX1P09620 729 aa7.66□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W CSN12P47130 423 aa7.66□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W SAM3Q08986 587 aa7.66□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.65□□□□□ -1.18not detected
YKR047WYKR047W GYP5Q12344 894 aa7.65□□□□□ -1.18
YKR047WYKR047W PKC1P24583 1151 aa7.64□□□□□ -1.19
YKR047WYKR047W SOL3P38858 249 aa7.62□□□□□ -1.19
YKR047WYKR047W TEA1P47988 759 aa7.6□□□□□ -1.19
YKR047WYKR047W ORC6P38826 435 aa7.59□□□□□ -1.19
YKR047WYKR047W GTT3P39996 337 aa7.59□□□□□ -1.19
YKR047WYKR047W YJL007CP47080 104 aa7.59□□□□□ -1.19
YKR047WYKR047W DCW1P36091 449 aa7.58□□□□□ -1.2
YKR047WYKR047W BIM1P40013 344 aa7.58□□□□□ -1.2
YKR047WYKR047W KTR1P27810 393 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YKR047WYKR047W GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YKR047WYKR047W ATG32P40458 529 aa7.54□□□□□ -1.2
YKR047WYKR047W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YKR047WYKR047W SSA1P10591 642 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YKR047WYKR047W NST1P53935 1240 aa7.53□□□□□ -1.2
YKR047WYKR047W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YKR047WYKR047W RGR1P19263 1082 aa7.52□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W CLB5P30283 435 aa7.52□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W YOL036WQ08206 761 aa7.52□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W MST1P07236 462 aa7.51□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W HTA2P04912 132 aa7.5□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W MPH3P0CE00 602 aa7.5□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W GEF1P37020 779 aa7.5□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W YBL036CP38197 257 aa7.5□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W SET4P42948 560 aa7.5□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W AI4P03878 556 aa7.49□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W MVP1P40959 511 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W YML020WQ03722 664 aa7.49□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W YMR196WQ04336 1088 aa7.48□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W TIF1P10081 395 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
YKR047WYKR047W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W SSA4P22202 642 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W FPK1P53739 893 aa7.46□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W NIS1P53939 407 aa7.46□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W ERG12P07277 443 aa7.45□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W SLX8P40072 274 aa7.45□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W HST2P53686 357 aa7.45□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W YPR109WQ06104 294 aa7.45□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W CSC1Q06538 782 aa7.45□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W MMP1Q12372 583 aa7.44□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W BIO2P32451 375 aa7.43□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W SLI15P38283 698 aa7.43□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W YPR204WQ08995 1032 aa7.43□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W ESS1P22696 170 aa7.42□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W DAN4P47179 1161 aa7.42□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W RAD59Q12223 238 aa7.42□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W MSB4Q12317 492 aa7.42□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W SCJ1P25303 377 aa7.41□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W CPS1P27614 576 aa7.41□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W RTG2P32608 588 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W YEL023CP39992 682 aa7.4□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
YKR047WYKR047W CSE4P36012 229 aa7.39□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W TTI1P36097 1038 aa7.39□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W PEX21P50091 288 aa7.39□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W YNL108CP53929 270 aa7.39□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W TFB4Q12004 338 aa7.39□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W CDC73Q06697 393 aa7.38□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W YJU3P28321 313 aa7.37□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W ARG8P18544 423 aa7.36□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W WSC3Q12215 556 aa7.36□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W SIT4P20604 311 aa7.35□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
YKR047WYKR047W EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W PTC4P38089 393 aa7.33□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W SUP45P12385 437 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W SLY41P22215 453 aa7.31□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YKR047WYKR047W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms