RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRR2	YHR106W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRR2	YHR106W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRR2	YHR106W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TRR2	YHR106W	BNI1	P41832	1953 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRR2	YHR106W	VPS15	P22219	1454 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRR2	YHR106W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TRR2	YHR106W	SNT2	P53127	1403 aa		11.55	□□□□□ -0.56
TRR2	YHR106W	STH1	P32597	1359 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRR2	YHR106W	DRS2	P39524	1355 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRR2	YHR106W	MLP2	P40457	1679 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRR2	YHR106W	ITT1	Q04638	464 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRR2	YHR106W	PDR12	Q02785	1511 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRR2	YHR106W	SPO14	P36126	1683 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRR2	YHR106W	ULS1	Q08562	1619 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRR2	YHR106W	NUP170	P38181	1502 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TRR2	YHR106W	MMS1	Q06211	1407 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TRR2	YHR106W	MET10	P39692	1035 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TRR2	YHR106W	IRC20	Q06554	1556 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRR2	YHR106W	GDB1	Q06625	1536 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRR2	YHR106W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TRR2	YHR106W	MIF2	P35201	549 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TRR2	YHR106W	TRM3	Q07527	1436 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TRR2	YHR106W	DNF2	Q12675	1612 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TRR2	YHR106W	RTT106	P40161	455 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TRR2	YHR106W	TAF7	Q05021	590 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRR2	YHR106W	BUD3	P25558	1636 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TRR2	YHR106W	DOP1	Q03921	1698 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TRR2	YHR106W	IQG1	Q12280	1495 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TRR2	YHR106W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TRR2	YHR106W	PDR10	P51533	1564 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRR2	YHR106W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TRR2	YHR106W	CAT8	P39113	1433 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRR2	YHR106W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRR2	YHR106W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRR2	YHR106W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRR2	YHR106W	YBT1	P32386	1661 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRR2	YHR106W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRR2	YHR106W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRR2	YHR106W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TRR2	YHR106W	IFH1	P39520	1085 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TRR2	YHR106W	YOR093C	Q12275	1648 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TRR2	YHR106W	YSP2	Q06681	1438 aa		11	□□□□□ -0.65
TRR2	YHR106W	DNF3	Q12674	1656 aa		10.92	□□□□□ -0.66
TRR2	YHR106W	YFR006W	P43590	535 aa		10.92	□□□□□ -0.66
TRR2	YHR106W	BNR1	P40450	1375 aa		10.91	□□□□□ -0.66
TRR2	YHR106W	SRB8	P25648	1427 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRR2	YHR106W	CKB1	P43639	278 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRR2	YHR106W	HAP1	P0CE41	1502 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRR2	YHR106W	YAP3	P38749	330 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRR2	YHR106W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TRR2	YHR106W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TRR2	YHR106W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
TRR2	YHR106W	MAK10	Q02197	733 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRR2	YHR106W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TRR2	YHR106W	VMR1	P38735	1592 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRR2	YHR106W	IML1	P47170	1584 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRR2	YHR106W	IPL1	P38991	367 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRR2	YHR106W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRR2	YHR106W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRR2	YHR106W	USO1	P25386	1790 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TRR2	YHR106W	GCN2	P15442	1659 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TRR2	YHR106W	SSM4	P40318	1319 aa		10.54	□□□□□ -0.72
TRR2	YHR106W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TRR2	YHR106W	YMR196W	Q04336	1088 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TRR2	YHR106W	PDR11	P40550	1411 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRR2	YHR106W	THI12	P42883	340 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TRR2	YHR106W	THI5	P43534	340 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TRR2	YHR106W	THI11	P47183	340 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TRR2	YHR106W	THI13	Q07748	340 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TRR2	YHR106W	RAV1	P47104	1357 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TRR2	YHR106W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
TRR2	YHR106W	BCK1	Q01389	1478 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRR2	YHR106W	NUP192	P47054	1683 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TRR2	YHR106W	PAF1	P38351	445 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRR2	YHR106W	RTC1	Q08281	1341 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRR2	YHR106W	KRE5	P22023	1365 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRR2	YHR106W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TRR2	YHR106W	MRX12	P47084	519 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TRR2	YHR106W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TRR2	YHR106W	RIA1	P53893	1110 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRR2	YHR106W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRR2	YHR106W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRR2	YHR106W	PTP3	P40048	928 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRR2	YHR106W	RAD9	P14737	1309 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRR2	YHR106W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TRR2	YHR106W	CAB1	Q04430	367 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRR2	YHR106W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TRR2	YHR106W	ESL2	P36168	1195 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TRR2	YHR106W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TRR2	YHR106W	YRF1-2	P40105	1681 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRR2	YHR106W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TRR2	YHR106W	APP1	P53933	587 aa		10	□□□□□ -0.81
TRR2	YHR106W	CPS1	P27614	576 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRR2	YHR106W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRR2	YHR106W	TAF8	Q03750	510 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRR2	YHR106W	FAP1	P53971	965 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRR2	YHR106W	REB1	P21538	810 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRR2	YHR106W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
TRR2	YHR106W	TAF5	P38129	798 aa		9.95	□□□□□ -0.82

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