RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-JR1P47098 1755 aa16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-ER1Q03612 1755 aa16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-GR2Q12269 1755 aa16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-OLQ12273 1755 aa16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SSA4YER103W VTH1P40438 1549 aa16.65■□□□□ 0.26
SSA4YER103W VTH2P40890 1549 aa16.65■□□□□ 0.26
SSA4YER103W MHP1P43638 1398 aa16.62■□□□□ 0.25
SSA4YER103W SNT2P53127 1403 aa16.62■□□□□ 0.25
SSA4YER103W GCN2P15442 1659 aa16.6■□□□□ 0.25
SSA4YER103W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SSA4YER103W TY1B-BRQ12193 1756 aa16.58■□□□□ 0.24
SSA4YER103W TY1B-GR3Q12316 1755 aa16.58■□□□□ 0.24
SSA4YER103W TY1B-ORQ92393 1755 aa16.58■□□□□ 0.24
SSA4YER103W CAT8P39113 1433 aa16.52■□□□□ 0.24
SSA4YER103W NOP7P53261 605 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SSA4YER103W IRC20Q06554 1556 aa16.49■□□□□ 0.23
SSA4YER103W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SSA4YER103W TY1B-ER2Q03619 1755 aa16.47■□□□□ 0.23
SSA4YER103W TY1B-MR1Q04214 1755 aa16.47■□□□□ 0.23
SSA4YER103W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SSA4YER103W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SSA4YER103W TY1B-NL1Q12112 1755 aa16.47■□□□□ 0.23
SSA4YER103W TY1B-GR1Q12141 1755 aa16.47■□□□□ 0.23
SSA4YER103W TY1B-BLQ12490 1755 aa16.47■□□□□ 0.23
SSA4YER103W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SSA4YER103W IME2P32581 645 aa16.45■□□□□ 0.22
SSA4YER103W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SSA4YER103W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SSA4YER103W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SSA4YER103W GDB1Q06625 1536 aa16.39■□□□□ 0.21
SSA4YER103W CLC1P17891 233 aa16.38■□□□□ 0.21
SSA4YER103W RPC31P17890 251 aa16.37■□□□□ 0.21
SSA4YER103W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SSA4YER103W OPY1P38271 328 aa16.33■□□□□ 0.2
SSA4YER103W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SSA4YER103W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SSA4YER103W CDC25P04821 1589 aa16.32■□□□□ 0.2
SSA4YER103W PDS5Q04264 1277 aa16.27■□□□□ 0.2
SSA4YER103W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SSA4YER103W CKB1P43639 278 aa16.25■□□□□ 0.19
SSA4YER103W EAF7P53911 425 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SSA4YER103W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SSA4YER103W NTE1Q04958 1679 aa16.22■□□□□ 0.19
SSA4YER103W NST1P53935 1240 aa16.21■□□□□ 0.19
SSA4YER103W IQG1Q12280 1495 aa16.21■□□□□ 0.19
SSA4YER103W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SSA4YER103W PDR12Q02785 1511 aa16.2■□□□□ 0.18
SSA4YER103W PAF1P38351 445 aa16.19■□□□□ 0.18
SSA4YER103W CDC45Q08032 650 aa16.13■□□□□ 0.17
SSA4YER103W FPR3P38911 411 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SSA4YER103W MMS1Q06211 1407 aa16.11■□□□□ 0.17
SSA4YER103W BUD3P25558 1636 aa16.1■□□□□ 0.17
SSA4YER103W YOR093CQ12275 1648 aa16.1■□□□□ 0.17
SSA4YER103W VPS27P40343 622 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SSA4YER103W RPP0P05317 312 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SSA4YER103W TCB2P48231 1178 aa16.09■□□□□ 0.17
SSA4YER103W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SSA4YER103W SNF7P39929 240 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SSA4YER103W LTE1P07866 1435 aa16.05■□□□□ 0.16
SSA4YER103W MNN4P36044 1178 aa16.04■□□□□ 0.16
SSA4YER103W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SSA4YER103W YIR014WP40570 242 aa16.02■□□□□ 0.15
SSA4YER103W SPO14P36126 1683 aa16.01■□□□□ 0.15
SSA4YER103W YSP2Q06681 1438 aa16■□□□□ 0.15
SSA4YER103W ABP1P15891 592 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SSA4YER103W TAF5P38129 798 aa15.98■□□□□ 0.15
SSA4YER103W KIP3P53086 805 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
SSA4YER103W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SSA4YER103W RAV1P47104 1357 aa15.94■□□□□ 0.14
SSA4YER103W RTC1Q08281 1341 aa15.93■□□□□ 0.14
SSA4YER103W DNF2Q12675 1612 aa15.92■□□□□ 0.14
SSA4YER103W ROX1P25042 368 aa15.92■□□□□ 0.14
SSA4YER103W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SSA4YER103W DOP1Q03921 1698 aa15.9■□□□□ 0.14
SSA4YER103W YDL144CQ07589 356 aa15.89■□□□□ 0.13
SSA4YER103W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SSA4YER103W MET10P39692 1035 aa15.87■□□□□ 0.13
SSA4YER103W ESL2P36168 1195 aa15.84■□□□□ 0.13
SSA4YER103W SUI2P20459 304 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SSA4YER103W DRS2P39524 1355 aa15.83■□□□□ 0.13
SSA4YER103W PDR11P40550 1411 aa15.82■□□□□ 0.12
SSA4YER103W PCT1P13259 424 aa15.8■□□□□ 0.12
SSA4YER103W LEO1P38439 464 aa15.8■□□□□ 0.12
SSA4YER103W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SSA4YER103W SCT1P32784 759 aa15.8■□□□□ 0.12
SSA4YER103W DJP1P40564 432 aa15.79■□□□□ 0.12
SSA4YER103W IOC4Q04213 475 aa15.79■□□□□ 0.12
SSA4YER103W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SSA4YER103W SNF2P22082 1703 aa15.76■□□□□ 0.11
SSA4YER103W RTG3P38165 486 aa15.76■□□□□ 0.11
SSA4YER103W NUP192P47054 1683 aa15.75■□□□□ 0.11
SSA4YER103W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data15.74■□□□□ 0.11not detected
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms