RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640726.1

SLC35A3-223, Transcript of solute carrier family 35 member A3, human

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,636 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC35A3-223	ENST00000640726	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		35.08	■■■■□ 3.21
SLC35A3-223	ENST00000640726	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		35.05	■■■■□ 3.2
SLC35A3-223	ENST00000640726	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		35.04	■■■■□ 3.2
SLC35A3-223	ENST00000640726	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		35	■■■■□ 3.19
SLC35A3-223	ENST00000640726	IQGAP2	Q13576	1575 aa		34.95	■■■■□ 3.19
SLC35A3-223	ENST00000640726	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		34.94	■■■■□ 3.18
SLC35A3-223	ENST00000640726	JPH4	Q96JJ6	628 aa		34.88	■■■■□ 3.17
SLC35A3-223	ENST00000640726	SHROOM2	Q13796	1616 aa		34.82	■■■■□ 3.16
SLC35A3-223	ENST00000640726	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		34.79	■■■■□ 3.16
SLC35A3-223	ENST00000640726	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	34.76	■■■■□ 3.15
SLC35A3-223	ENST00000640726	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	34.72	■■■■□ 3.15
SLC35A3-223	ENST00000640726	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		34.66	■■■■□ 3.14
SLC35A3-223	ENST00000640726	DISP1	Q96F81	1524 aa		34.66	■■■■□ 3.14
SLC35A3-223	ENST00000640726	CEP162	Q5TB80	1403 aa		34.65	■■■■□ 3.14
SLC35A3-223	ENST00000640726	SAMD9	Q5K651	1589 aa		34.63	■■■■□ 3.13
SLC35A3-223	ENST00000640726	CLIP1	P30622	1438 aa		34.62	■■■■□ 3.13
SLC35A3-223	ENST00000640726	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		34.62	■■■■□ 3.13
SLC35A3-223	ENST00000640726	KIAA0556	O60303	1618 aa		34.6	■■■■□ 3.13
SLC35A3-223	ENST00000640726	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		34.59	■■■■□ 3.13
SLC35A3-223	ENST00000640726	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		34.58	■■■■□ 3.13
SLC35A3-223	ENST00000640726	P3H3	Q8IVL6	736 aa		34.55	■■■■□ 3.12
SLC35A3-223	ENST00000640726	ARHGEF11	O15085	1522 aa		34.55	■■■■□ 3.12
SLC35A3-223	ENST00000640726	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.49	■■■■□ 3.11
SLC35A3-223	ENST00000640726	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		34.47	■■■■□ 3.11
SLC35A3-223	ENST00000640726	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		34.46	■■■■□ 3.11
SLC35A3-223	ENST00000640726	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		34.46	■■■■□ 3.11
SLC35A3-223	ENST00000640726	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		34.46	■■■■□ 3.11
SLC35A3-223	ENST00000640726	ARAP1	Q96P48	1450 aa		34.42	■■■■□ 3.1
SLC35A3-223	ENST00000640726	PTPRG	P23470	1445 aa		34.41	■■■■□ 3.1
SLC35A3-223	ENST00000640726	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	34.39	■■■■□ 3.1
SLC35A3-223	ENST00000640726	FMN1	Q68DA7	1419 aa		34.31	■■■■□ 3.08
SLC35A3-223	ENST00000640726	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		34.23	■■■■□ 3.07
SLC35A3-223	ENST00000640726	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		34.2	■■■■□ 3.07
SLC35A3-223	ENST00000640726	UACA	Q9BZF9	1416 aa		34.2	■■■■□ 3.06
SLC35A3-223	ENST00000640726	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		34.18	■■■■□ 3.06
SLC35A3-223	ENST00000640726	ABCA8	O94911	1581 aa		34.18	■■■■□ 3.06
SLC35A3-223	ENST00000640726	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		34.15	■■■■□ 3.06
SLC35A3-223	ENST00000640726	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		34.13	■■■■□ 3.05
SLC35A3-223	ENST00000640726	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		34.11	■■■■□ 3.05
SLC35A3-223	ENST00000640726	ABCC2	Q92887	1545 aa		34.1	■■■■□ 3.05
SLC35A3-223	ENST00000640726	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	34.1	■■■■□ 3.05
SLC35A3-223	ENST00000640726	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		34.07	■■■■□ 3.05
SLC35A3-223	ENST00000640726	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	34.07	■■■■□ 3.04
SLC35A3-223	ENST00000640726	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		34.06	■■■■□ 3.04
SLC35A3-223	ENST00000640726	HECW1	Q76N89	1606 aa		34.04	■■■■□ 3.04
SLC35A3-223	ENST00000640726	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
SLC35A3-223	ENST00000640726	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.95	■■■■□ 3.02
SLC35A3-223	ENST00000640726	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.94	■■■■□ 3.02
SLC35A3-223	ENST00000640726	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
SLC35A3-223	ENST00000640726	ATP10B	O94823	1461 aa		33.92	■■■■□ 3.02
SLC35A3-223	ENST00000640726	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.92	■■■■□ 3.02
SLC35A3-223	ENST00000640726	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.91	■■■■□ 3.02
SLC35A3-223	ENST00000640726	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.9	■■■■□ 3.02
SLC35A3-223	ENST00000640726	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
SLC35A3-223	ENST00000640726	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
SLC35A3-223	ENST00000640726	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
SLC35A3-223	ENST00000640726	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
SLC35A3-223	ENST00000640726	APLP2	Q06481	763 aa		33.84	■■■■□ 3.01
SLC35A3-223	ENST00000640726	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.79	■■■■□ 3
SLC35A3-223	ENST00000640726	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
SLC35A3-223	ENST00000640726	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.77	■■■■□ 3
SLC35A3-223	ENST00000640726	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.76	■■■□□ 2.99
SLC35A3-223	ENST00000640726	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		33.74	■■■□□ 2.99
SLC35A3-223	ENST00000640726	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SLC35A3-223	ENST00000640726	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.7	■■■□□ 2.98
SLC35A3-223	ENST00000640726	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.65	■■■□□ 2.98
SLC35A3-223	ENST00000640726	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.64	■■■□□ 2.98
SLC35A3-223	ENST00000640726	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.64	■■■□□ 2.98
SLC35A3-223	ENST00000640726	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
SLC35A3-223	ENST00000640726	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
SLC35A3-223	ENST00000640726	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SLC35A3-223	ENST00000640726	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SLC35A3-223	ENST00000640726	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SLC35A3-223	ENST00000640726	KIF14	Q15058	1648 aa		33.48	■■■□□ 2.95
SLC35A3-223	ENST00000640726	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
SLC35A3-223	ENST00000640726	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SLC35A3-223	ENST00000640726	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
SLC35A3-223	ENST00000640726	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SLC35A3-223	ENST00000640726	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SLC35A3-223	ENST00000640726	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	33.4	■■■□□ 2.94
SLC35A3-223	ENST00000640726	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SLC35A3-223	ENST00000640726	GLI2	P10070	1586 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SLC35A3-223	ENST00000640726	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SLC35A3-223	ENST00000640726	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SLC35A3-223	ENST00000640726	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SLC35A3-223	ENST00000640726	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SLC35A3-223	ENST00000640726	CD109	Q6YHK3	1445 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SLC35A3-223	ENST00000640726	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
SLC35A3-223	ENST00000640726	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SLC35A3-223	ENST00000640726	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SLC35A3-223	ENST00000640726	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SLC35A3-223	ENST00000640726	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SLC35A3-223	ENST00000640726	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SLC35A3-223	ENST00000640726	PLCH2	O75038	1416 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SLC35A3-223	ENST00000640726	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SLC35A3-223	ENST00000640726	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SLC35A3-223	ENST00000640726	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SLC35A3-223	ENST00000640726	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SLC35A3-223	ENST00000640726	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SLC35A3-223	ENST00000640726	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9

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