RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635550.1

SEC24C-207, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC24C, Length 3,424 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-207ENST00000635550 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.79□□□□□ -0.68
SEC24C-207ENST00000635550 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.78□□□□□ -0.68
SEC24C-207ENST00000635550 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.78□□□□□ -0.68
SEC24C-207ENST00000635550 MAP3K1Q13233 1512 aa10.78□□□□□ -0.68
SEC24C-207ENST00000635550 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 TOPBP1Q92547 1522 aa10.76□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.76□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 FHOD3Q2V2M9 1422 aa10.75□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.75□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.75□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 MAPKBP1O60336 1514 aa10.74□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 SETD5Q9C0A6 1442 aa10.72□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.72□□□□□ -0.69
SEC24C-207ENST00000635550 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.69□□□□□ -0.7
SEC24C-207ENST00000635550 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
SEC24C-207ENST00000635550 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.68□□□□□ -0.7
SEC24C-207ENST00000635550 CUL7Q14999 1698 aa10.68□□□□□ -0.7
SEC24C-207ENST00000635550 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
SEC24C-207ENST00000635550 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.68□□□□□ -0.7
SEC24C-207ENST00000635550 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.67□□□□□ -0.7
SEC24C-207ENST00000635550 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.67□□□□□ -0.7
SEC24C-207ENST00000635550 WDR97A6NE52 1622 aa10.65□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 28.4
SEC24C-207ENST00000635550 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 FMN1Q68DA7 1419 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 KCNH8Q96L42 1107 aa10.62□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.62□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.61□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.61□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.61□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.6□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.712e-8■■■■□ 20.8
SEC24C-207ENST00000635550 SAMD9Q5K651 1589 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 PTPRKQ15262 1439 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-207ENST00000635550 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 GRIN2BQ13224 1484 aa10.56□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 NCOA2Q15596 1464 aa10.55□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.55□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.55□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 HFM1A2PYH4 1435 aa10.54□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.53□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.53□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.52□□□□□ -0.72
SEC24C-207ENST00000635550 NAIPQ13075 1403 aa10.52□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 UACAQ9BZF9 1416 aa10.51□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 TONSLQ96HA7 1378 aa10.5□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.49□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 ARID3CA6NKF2 412 aa10.49□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.49□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.49□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.49□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 ARHGEF11O15085 1522 aa10.48□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 PBRM1Q86U86 1689 aa10.48□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 IQGAP2Q13576 1575 aa10.46□□□□□ -0.73
SEC24C-207ENST00000635550 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 ADAMTS12P58397 1594 aa10.44□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 HECW1Q76N89 1606 aa10.44□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10.44□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 KDM6BO15054 1643 aa10.44□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 ANP32CO43423 234 aa10.42□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 ERCC6Q03468 1493 aa10.42□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.42□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 TRIM52Q96A61 297 aa10.42□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 WDR62O43379 1518 aa10.41□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 FOXD1Q16676 465 aa10.4□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.4□□□□□ -0.74
SEC24C-207ENST00000635550 CCER2I3L3R5 266 aa10.4□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 BCANQ96GW7 911 aa10.38□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.38□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 MIA2Q96PC5 1412 aa10.38□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 DISP1Q96F81 1524 aa10.37□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.37□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 FKBP8Q14318 412 aa10.37□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 AKNAQ7Z591 1439 aa10.36□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.36□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 IFT140Q96RY7 1462 aa10.35□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.35□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.35□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 KIAA0556O60303 1618 aa10.35□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.35□□□□□ -0.75
SEC24C-207ENST00000635550 DAPK1P53355 1430 aa10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms