RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
GLIS1-202ENST00000628545 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.53■■□□□ 1.52
GLIS1-202ENST00000628545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.53■■□□□ 1.52
GLIS1-202ENST00000628545 CCER2I3L3R5 266 aa24.51■■□□□ 1.51
GLIS1-202ENST00000628545 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GLIS1-202ENST00000628545 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
GLIS1-202ENST00000628545 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.45■■□□□ 1.5
GLIS1-202ENST00000628545 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
GLIS1-202ENST00000628545 ANP32CO43423 234 aa24.42■■□□□ 1.5
GLIS1-202ENST00000628545 CFTRP13569 1480 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS1-202ENST00000628545 KIF21BO75037 1637 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS1-202ENST00000628545 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GLIS1-202ENST00000628545 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GLIS1-202ENST00000628545 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.33■■□□□ 1.49
GLIS1-202ENST00000628545 CUX2O14529 1486 aa24.32■■□□□ 1.48
GLIS1-202ENST00000628545 WDR97A6NE52 1622 aa24.32■■□□□ 1.48
GLIS1-202ENST00000628545 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.31■■□□□ 1.48
GLIS1-202ENST00000628545 SLC24A1O60721 1099 aa24.3■■□□□ 1.48
GLIS1-202ENST00000628545 MAPKBP1O60336 1514 aa24.29■■□□□ 1.48
GLIS1-202ENST00000628545 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
GLIS1-202ENST00000628545 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GLIS1-202ENST00000628545 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GLIS1-202ENST00000628545 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GLIS1-202ENST00000628545 PRDM2Q13029 1718 aa24.22■■□□□ 1.47
GLIS1-202ENST00000628545 NESP48681 1621 aa24.22■■□□□ 1.47
GLIS1-202ENST00000628545 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.22■■□□□ 1.47
GLIS1-202ENST00000628545 PLEKHG5O94827 1062 aa24.2■■□□□ 1.46
GLIS1-202ENST00000628545 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GLIS1-202ENST00000628545 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.17■■□□□ 1.46
GLIS1-202ENST00000628545 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.17■■□□□ 1.46
GLIS1-202ENST00000628545 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.17■■□□□ 1.46
GLIS1-202ENST00000628545 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
GLIS1-202ENST00000628545 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.14■■□□□ 1.45
GLIS1-202ENST00000628545 SYNJ1O43426 1573 aa24.13■■□□□ 1.45
GLIS1-202ENST00000628545 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.13■■□□□ 1.45
GLIS1-202ENST00000628545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.12■■□□□ 1.45
GLIS1-202ENST00000628545 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GLIS1-202ENST00000628545 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
GLIS1-202ENST00000628545 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.08■■□□□ 1.45
GLIS1-202ENST00000628545 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.07■■□□□ 1.44
GLIS1-202ENST00000628545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.06■■□□□ 1.44
GLIS1-202ENST00000628545 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GLIS1-202ENST00000628545 ARAP1Q96P48 1450 aa24.02■■□□□ 1.44
GLIS1-202ENST00000628545 CUX1P39880 1505 aa24.01■■□□□ 1.43
GLIS1-202ENST00000628545 TOP2BQ02880 1626 aa24■■□□□ 1.43
GLIS1-202ENST00000628545 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24■■□□□ 1.43
GLIS1-202ENST00000628545 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.98■■□□□ 1.43
GLIS1-202ENST00000628545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.98■■□□□ 1.43
GLIS1-202ENST00000628545 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.95■■□□□ 1.42
GLIS1-202ENST00000628545 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.94■■□□□ 1.42
GLIS1-202ENST00000628545 ZMYND15Q9H091 742 aa23.93■■□□□ 1.42
GLIS1-202ENST00000628545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.93■■□□□ 1.42
GLIS1-202ENST00000628545 USP35Q9P2H5 1018 aa23.92■■□□□ 1.42
GLIS1-202ENST00000628545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.91■■□□□ 1.42
GLIS1-202ENST00000628545 NEFMP07197 916 aa23.9■■□□□ 1.42
GLIS1-202ENST00000628545 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.9■■□□□ 1.42
GLIS1-202ENST00000628545 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
GLIS1-202ENST00000628545 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.83■■□□□ 1.4
GLIS1-202ENST00000628545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.8■■□□□ 1.4
GLIS1-202ENST00000628545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
GLIS1-202ENST00000628545 TOPBP1Q92547 1522 aa23.79■■□□□ 1.4
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC184Q52MB2 194 aa23.79■■□□□ 1.4
GLIS1-202ENST00000628545 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.77■■□□□ 1.4
GLIS1-202ENST00000628545 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
GLIS1-202ENST00000628545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.76■■□□□ 1.39
GLIS1-202ENST00000628545 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.75■■□□□ 1.39
GLIS1-202ENST00000628545 TONSLQ96HA7 1378 aa23.73■■□□□ 1.39
GLIS1-202ENST00000628545 GSE1Q14687 1217 aa23.72■■□□□ 1.39
GLIS1-202ENST00000628545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.7■■□□□ 1.38
GLIS1-202ENST00000628545 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GLIS1-202ENST00000628545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
GLIS1-202ENST00000628545 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.68■■□□□ 1.38
GLIS1-202ENST00000628545 AKNAQ7Z591 1439 aa23.67■■□□□ 1.38
GLIS1-202ENST00000628545 ERCC6Q03468 1493 aa23.66■■□□□ 1.38
GLIS1-202ENST00000628545 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.66■■□□□ 1.38
GLIS1-202ENST00000628545 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
GLIS1-202ENST00000628545 PRXQ9BXM0 1461 aa23.63■■□□□ 1.37
GLIS1-202ENST00000628545 MRS2Q9HD23 443 aa23.63■■□□□ 1.37
GLIS1-202ENST00000628545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.62■■□□□ 1.37
GLIS1-202ENST00000628545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.61■■□□□ 1.37
GLIS1-202ENST00000628545 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.57■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.56■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 KIF27Q86VH2 1401 aa23.56■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.56■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 WDR62O43379 1518 aa23.55■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.55■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 TIAM1Q13009 1591 aa23.53■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.52■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 NCOA2Q15596 1464 aa23.52■■□□□ 1.36
GLIS1-202ENST00000628545 PDE4AP27815 886 aa23.51■■□□□ 1.35
GLIS1-202ENST00000628545 NUDCQ9Y266 331 aa23.51■■□□□ 1.35
GLIS1-202ENST00000628545 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
GLIS1-202ENST00000628545 NFKBIBQ15653 356 aa23.48■■□□□ 1.35
GLIS1-202ENST00000628545 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.46■■□□□ 1.35
GLIS1-202ENST00000628545 BACH2Q9BYV9 841 aa23.46■■□□□ 1.35
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