RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.38□□□□□ -0.59
PCAT5-201ENST00000626667 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.38□□□□□ -0.59
PCAT5-201ENST00000626667 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.37□□□□□ -0.59
PCAT5-201ENST00000626667 TIAM1Q13009 1591 aa11.37□□□□□ -0.59
PCAT5-201ENST00000626667 TOPBP1Q92547 1522 aa11.37□□□□□ -0.59
PCAT5-201ENST00000626667 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.36□□□□□ -0.59
PCAT5-201ENST00000626667 ADAMTS12P58397 1594 aa11.35□□□□□ -0.59
PCAT5-201ENST00000626667 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.35□□□□□ -0.59
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PCAT5-201ENST00000626667 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PCAT5-201ENST00000626667 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.3□□□□□ -0.6
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PCAT5-201ENST00000626667 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.3□□□□□ -0.6
PCAT5-201ENST00000626667 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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PCAT5-201ENST00000626667 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.22□□□□□ -0.61
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PCAT5-201ENST00000626667 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.2□□□□□ -0.62
PCAT5-201ENST00000626667 RNF39Q9H2S5 420 aa11.2□□□□□ -0.62
PCAT5-201ENST00000626667 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.19□□□□□ -0.62
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PCAT5-201ENST00000626667 HECW1Q76N89 1606 aa11.15□□□□□ -0.62
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PCAT5-201ENST00000626667 KIF27Q86VH2 1401 aa11.13□□□□□ -0.63
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PCAT5-201ENST00000626667 IQGAP2Q13576 1575 aa11.12□□□□□ -0.63
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PCAT5-201ENST00000626667 NESP48681 1621 aa11.12□□□□□ -0.63
PCAT5-201ENST00000626667 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.09□□□□□ -0.63
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PCAT5-201ENST00000626667 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.09□□□□□ -0.63
PCAT5-201ENST00000626667 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.08□□□□□ -0.64
PCAT5-201ENST00000626667 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.08□□□□□ -0.64
PCAT5-201ENST00000626667 CEP170Q5SW79 1584 aa11.06□□□□□ -0.64
PCAT5-201ENST00000626667 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PCAT5-201ENST00000626667 DISP1Q96F81 1524 aa11.06□□□□□ -0.64
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PCAT5-201ENST00000626667 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11□□□□□ -0.65
PCAT5-201ENST00000626667 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11□□□□□ -0.65
PCAT5-201ENST00000626667 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.99□□□□□ -0.65
PCAT5-201ENST00000626667 KDM6BO15054 1643 aa10.98□□□□□ -0.65
PCAT5-201ENST00000626667 E9PCH4 1651 aa10.97□□□□□ -0.65
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PCAT5-201ENST00000626667 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.94□□□□□ -0.66
PCAT5-201ENST00000626667 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.93□□□□□ -0.66
PCAT5-201ENST00000626667 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.93□□□□□ -0.66
PCAT5-201ENST00000626667 IFT140Q96RY7 1462 aa10.93□□□□□ -0.66
PCAT5-201ENST00000626667 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.92□□□□□ -0.66
PCAT5-201ENST00000626667 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
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PCAT5-201ENST00000626667 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.9□□□□□ -0.66
PCAT5-201ENST00000626667 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.9□□□□□ -0.66
PCAT5-201ENST00000626667 LAMC1P11047 1609 aa10.9□□□□□ -0.66
PCAT5-201ENST00000626667 DEPDC5O75140 1603 aa10.9□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 ADGRL2O95490 1459 aa10.89□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 CHD1O14646 1710 aa10.89□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 PTPRKQ15262 1439 aa10.88□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.88□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 PREX2Q70Z35 1606 aa10.88□□□□□ -0.67
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PCAT5-201ENST00000626667 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.87□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 UNC13BO14795 1591 aa10.87□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.86□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.86□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 IFT172Q9UG01 1749 aa10.85□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.84□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.84□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.83□□□□□ -0.67
PCAT5-201ENST00000626667 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 PLXNC1O60486 1568 aa10.83□□□□□ -0.68
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