RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.72■□□□□ 0.75
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C9orf170-201ENST00000623052 WDR97A6NE52 1622 aa19.68■□□□□ 0.74
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C9orf170-201ENST00000623052 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.62■□□□□ 0.73
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C9orf170-201ENST00000623052 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.55■□□□□ 0.72
C9orf170-201ENST00000623052 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.54■□□□□ 0.72
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C9orf170-201ENST00000623052 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.46■□□□□ 0.71
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C9orf170-201ENST00000623052 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
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C9orf170-201ENST00000623052 FMN1Q68DA7 1419 aa19.4■□□□□ 0.7
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C9orf170-201ENST00000623052 GRIN2BQ13224 1484 aa19.39■□□□□ 0.69
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C9orf170-201ENST00000623052 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
C9orf170-201ENST00000623052 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.32■□□□□ 0.68
C9orf170-201ENST00000623052 PBRM1Q86U86 1689 aa19.32■□□□□ 0.68
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C9orf170-201ENST00000623052 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.31■□□□□ 0.68
C9orf170-201ENST00000623052 NCOA2Q15596 1464 aa19.3■□□□□ 0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF11O15085 1522 aa19.28■□□□□ 0.68
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C9orf170-201ENST00000623052 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.28■□□□□ 0.68
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C9orf170-201ENST00000623052 KCNH8Q96L42 1107 aa19.27■□□□□ 0.68
C9orf170-201ENST00000623052 HFM1A2PYH4 1435 aa19.27■□□□□ 0.68
C9orf170-201ENST00000623052 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.27■□□□□ 0.67
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C9orf170-201ENST00000623052 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.16■□□□□ 0.66
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C9orf170-201ENST00000623052 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.66
C9orf170-201ENST00000623052 KDM6BO15054 1643 aa19.14■□□□□ 0.65
C9orf170-201ENST00000623052 WDR62O43379 1518 aa19.14■□□□□ 0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
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C9orf170-201ENST00000623052 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.1■□□□□ 0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TONSLQ96HA7 1378 aa19.07■□□□□ 0.64
C9orf170-201ENST00000623052 AKNAQ7Z591 1439 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA0556O60303 1618 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf170-201ENST00000623052 DISP1Q96F81 1524 aa19.02■□□□□ 0.63
C9orf170-201ENST00000623052 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.01■□□□□ 0.63
C9orf170-201ENST00000623052 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.99■□□□□ 0.63
C9orf170-201ENST00000623052 MIA2Q96PC5 1412 aa18.99■□□□□ 0.63
C9orf170-201ENST00000623052 IFT140Q96RY7 1462 aa18.97■□□□□ 0.63
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C9orf170-201ENST00000623052 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.93■□□□□ 0.62
C9orf170-201ENST00000623052 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.93■□□□□ 0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CCER2I3L3R5 266 aa18.93■□□□□ 0.62
C9orf170-201ENST00000623052 GRIN2AQ12879 1464 aa18.91■□□□□ 0.62
C9orf170-201ENST00000623052 DAPK1P53355 1430 aa18.91■□□□□ 0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ABCC5O15440 1437 aa18.88■□□□□ 0.61
C9orf170-201ENST00000623052 ANP32CO43423 234 aa18.87■□□□□ 0.61
C9orf170-201ENST00000623052 CEP170Q5SW79 1584 aa18.86■□□□□ 0.61
C9orf170-201ENST00000623052 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.85■□□□□ 0.61
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
C9orf170-201ENST00000623052 FOXD1Q16676 465 aa18.85■□□□□ 0.61
C9orf170-201ENST00000623052 ROCK1Q13464 1354 aa18.85■□□□□ 0.61
C9orf170-201ENST00000623052 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.84■□□□□ 0.61
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM52Q96A61 297 aa18.84■□□□□ 0.61
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