RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622220.1

RNFT2-209, Transcript of ring finger protein, transmembrane 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RNFT2, Length 2,176 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2-209ENST00000622220 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.05■■□□□ 1.92
RNFT2-209ENST00000622220 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
RNFT2-209ENST00000622220 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.02■■□□□ 1.92
RNFT2-209ENST00000622220 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27■■□□□ 1.91
RNFT2-209ENST00000622220 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.98■■□□□ 1.91
RNFT2-209ENST00000622220 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
RNFT2-209ENST00000622220 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.95■■□□□ 1.9
RNFT2-209ENST00000622220 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.95e-8■■■■■ 40.1
RNFT2-209ENST00000622220 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.93■■□□□ 1.9
RNFT2-209ENST00000622220 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.9■■□□□ 1.9
RNFT2-209ENST00000622220 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.9■■□□□ 1.9
RNFT2-209ENST00000622220 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.89■■□□□ 1.9
RNFT2-209ENST00000622220 P3H3Q8IVL6 736 aa26.88■■□□□ 1.89
RNFT2-209ENST00000622220 FMN1Q68DA7 1419 aa26.86■■□□□ 1.89
RNFT2-209ENST00000622220 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.86■■□□□ 1.89
RNFT2-209ENST00000622220 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
RNFT2-209ENST00000622220 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
RNFT2-209ENST00000622220 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
RNFT2-209ENST00000622220 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
RNFT2-209ENST00000622220 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.84■■□□□ 1.89
RNFT2-209ENST00000622220 ITGAEP38570 1179 aa26.8■■□□□ 1.88
RNFT2-209ENST00000622220 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
RNFT2-209ENST00000622220 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.77■■□□□ 1.88
RNFT2-209ENST00000622220 SAMD9Q5K651 1589 aa26.77■■□□□ 1.88
RNFT2-209ENST00000622220 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
RNFT2-209ENST00000622220 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.76■■□□□ 1.87
RNFT2-209ENST00000622220 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
RNFT2-209ENST00000622220 NEUROD1Q13562 356 aa26.73■■□□□ 1.87
RNFT2-209ENST00000622220 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.72■■□□□ 1.87
RNFT2-209ENST00000622220 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
RNFT2-209ENST00000622220 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
RNFT2-209ENST00000622220 MIER1Q8N108 512 aa26.64■■□□□ 1.85
RNFT2-209ENST00000622220 ERCC6Q03468 1493 aa26.62■■□□□ 1.85
RNFT2-209ENST00000622220 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.62■■□□□ 1.85
RNFT2-209ENST00000622220 MAPKBP1O60336 1514 aa26.62■■□□□ 1.85
RNFT2-209ENST00000622220 PBRM1Q86U86 1689 aa26.62■■□□□ 1.85
RNFT2-209ENST00000622220 GRIN2BQ13224 1484 aa26.6■■□□□ 1.85
RNFT2-209ENST00000622220 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.6■■□□□ 1.85
RNFT2-209ENST00000622220 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.58■■□□□ 1.85
RNFT2-209ENST00000622220 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.54■■□□□ 1.84
RNFT2-209ENST00000622220 ADAMTS12P58397 1594 aa26.52■■□□□ 1.84
RNFT2-209ENST00000622220 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.5■■□□□ 1.83
RNFT2-209ENST00000622220 IQGAP2Q13576 1575 aa26.49■■□□□ 1.83
RNFT2-209ENST00000622220 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.49■■□□□ 1.83
RNFT2-209ENST00000622220 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RNFT2-209ENST00000622220 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.48■■□□□ 1.83
RNFT2-209ENST00000622220 NCOA2Q15596 1464 aa26.47■■□□□ 1.83
RNFT2-209ENST00000622220 IFT140Q96RY7 1462 aa26.47■■□□□ 1.83
RNFT2-209ENST00000622220 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.46■■□□□ 1.83
RNFT2-209ENST00000622220 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.44■■□□□ 1.82
RNFT2-209ENST00000622220 WDR62O43379 1518 aa26.43■■□□□ 1.82
RNFT2-209ENST00000622220 HECW1Q76N89 1606 aa26.42■■□□□ 1.82
RNFT2-209ENST00000622220 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
RNFT2-209ENST00000622220 ARHGEF11O15085 1522 aa26.39■■□□□ 1.82
RNFT2-209ENST00000622220 HFM1A2PYH4 1435 aa26.39■■□□□ 1.81
RNFT2-209ENST00000622220 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.39■■□□□ 1.81
RNFT2-209ENST00000622220 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.33■■□□□ 1.81
RNFT2-209ENST00000622220 PTPRKQ15262 1439 aa26.32■■□□□ 1.8
RNFT2-209ENST00000622220 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.32■■□□□ 1.8
RNFT2-209ENST00000622220 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
RNFT2-209ENST00000622220 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.32■■□□□ 1.8
RNFT2-209ENST00000622220 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
RNFT2-209ENST00000622220 UACAQ9BZF9 1416 aa26.3■■□□□ 1.8
RNFT2-209ENST00000622220 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.29■■□□□ 1.8
RNFT2-209ENST00000622220 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
RNFT2-209ENST00000622220 NAIPQ13075 1403 aa26.27■■□□□ 1.8
RNFT2-209ENST00000622220 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
RNFT2-209ENST00000622220 MIA2Q96PC5 1412 aa26.23■■□□□ 1.79
RNFT2-209ENST00000622220 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
RNFT2-209ENST00000622220 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
RNFT2-209ENST00000622220 GRIN2AQ12879 1464 aa26.2■■□□□ 1.79
RNFT2-209ENST00000622220 KIAA0556O60303 1618 aa26.2■■□□□ 1.78
RNFT2-209ENST00000622220 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
RNFT2-209ENST00000622220 AKNAQ7Z591 1439 aa26.18■■□□□ 1.78
RNFT2-209ENST00000622220 DISP1Q96F81 1524 aa26.18■■□□□ 1.78
RNFT2-209ENST00000622220 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
RNFT2-209ENST00000622220 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.14■■□□□ 1.78
RNFT2-209ENST00000622220 TONSLQ96HA7 1378 aa26.14■■□□□ 1.77
RNFT2-209ENST00000622220 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.08■■□□□ 1.77
RNFT2-209ENST00000622220 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
RNFT2-209ENST00000622220 SYNJ2O15056 1496 aa26.07■■□□□ 1.76
RNFT2-209ENST00000622220 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
RNFT2-209ENST00000622220 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.05■■□□□ 1.76
RNFT2-209ENST00000622220 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
RNFT2-209ENST00000622220 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.02■■□□□ 1.76
RNFT2-209ENST00000622220 ROCK1Q13464 1354 aa25.99■■□□□ 1.75
RNFT2-209ENST00000622220 ARID3CA6NKF2 412 aa25.99■■□□□ 1.75
RNFT2-209ENST00000622220 CEP170Q5SW79 1584 aa25.99■■□□□ 1.75
RNFT2-209ENST00000622220 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
RNFT2-209ENST00000622220 DAPK1P53355 1430 aa25.95■■□□□ 1.75
RNFT2-209ENST00000622220 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
RNFT2-209ENST00000622220 NUP160Q12769 1436 aa25.94■■□□□ 1.74
RNFT2-209ENST00000622220 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.94■■□□□ 1.74
RNFT2-209ENST00000622220 TRIM52Q96A61 297 aa25.93■■□□□ 1.74
RNFT2-209ENST00000622220 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
RNFT2-209ENST00000622220 KDM6BO15054 1643 aa25.91■■□□□ 1.74
RNFT2-209ENST00000622220 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
RNFT2-209ENST00000622220 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.9■■□□□ 1.74
RNFT2-209ENST00000622220 ABCC5O15440 1437 aa25.89■■□□□ 1.74
RNFT2-209ENST00000622220 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms