RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616622.1

ARHGEF25-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 25, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ARHGEF25, Length 2,103 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF25-208ENST00000616622 TOPBP1Q92547 1522 aa24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF25-208ENST00000616622 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
ARHGEF25-208ENST00000616622 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF25-208ENST00000616622 CUL7Q14999 1698 aa24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF25-208ENST00000616622 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF25-208ENST00000616622 WDR97A6NE52 1622 aa24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF25-208ENST00000616622 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF25-208ENST00000616622 NESP48681 1621 aa24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF25-208ENST00000616622 MAPKBP1O60336 1514 aa24.83■■□□□ 1.56
ARHGEF25-208ENST00000616622 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF25-208ENST00000616622 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF25-208ENST00000616622 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF25-208ENST00000616622 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF25-208ENST00000616622 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF25-208ENST00000616622 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.552e-8■■■■■ 35.8
ARHGEF25-208ENST00000616622 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF25-208ENST00000616622 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF25-208ENST00000616622 ITGAEP38570 1179 aa24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF25-208ENST00000616622 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF25-208ENST00000616622 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF25-208ENST00000616622 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF25-208ENST00000616622 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF25-208ENST00000616622 P3H3Q8IVL6 736 aa24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF25-208ENST00000616622 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF25-208ENST00000616622 SAMD9Q5K651 1589 aa24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF25-208ENST00000616622 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF25-208ENST00000616622 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF25-208ENST00000616622 FMN1Q68DA7 1419 aa24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF25-208ENST00000616622 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF25-208ENST00000616622 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF25-208ENST00000616622 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF25-208ENST00000616622 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF25-208ENST00000616622 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF25-208ENST00000616622 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF25-208ENST00000616622 GRIN2BQ13224 1484 aa24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF25-208ENST00000616622 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF25-208ENST00000616622 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF25-208ENST00000616622 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF25-208ENST00000616622 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF25-208ENST00000616622 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF25-208ENST00000616622 PTPRKQ15262 1439 aa24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 PBRM1Q86U86 1689 aa24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 NCOA2Q15596 1464 aa24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 ARHGEF11O15085 1522 aa24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 HFM1A2PYH4 1435 aa24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF25-208ENST00000616622 UACAQ9BZF9 1416 aa24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF25-208ENST00000616622 ADAMTS12P58397 1594 aa24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF25-208ENST00000616622 NAIPQ13075 1403 aa24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF25-208ENST00000616622 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF25-208ENST00000616622 HECW1Q76N89 1606 aa24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF25-208ENST00000616622 IQGAP2Q13576 1575 aa24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF25-208ENST00000616622 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF25-208ENST00000616622 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF25-208ENST00000616622 KCNH8Q96L42 1107 aa24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF25-208ENST00000616622 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF25-208ENST00000616622 WDR62O43379 1518 aa24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF25-208ENST00000616622 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF25-208ENST00000616622 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF25-208ENST00000616622 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF25-208ENST00000616622 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF25-208ENST00000616622 TONSLQ96HA7 1378 aa24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF25-208ENST00000616622 AKNAQ7Z591 1439 aa24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF25-208ENST00000616622 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF25-208ENST00000616622 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF25-208ENST00000616622 KDM6BO15054 1643 aa24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF25-208ENST00000616622 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF25-208ENST00000616622 MIA2Q96PC5 1412 aa24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF25-208ENST00000616622 KIAA0556O60303 1618 aa24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF25-208ENST00000616622 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF25-208ENST00000616622 IFT140Q96RY7 1462 aa24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF25-208ENST00000616622 CCER2I3L3R5 266 aa23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF25-208ENST00000616622 DISP1Q96F81 1524 aa23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF25-208ENST00000616622 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF25-208ENST00000616622 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF25-208ENST00000616622 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF25-208ENST00000616622 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF25-208ENST00000616622 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF25-208ENST00000616622 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF25-208ENST00000616622 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF25-208ENST00000616622 ANP32CO43423 234 aa23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF25-208ENST00000616622 DAPK1P53355 1430 aa23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF25-208ENST00000616622 GRIN2AQ12879 1464 aa23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF25-208ENST00000616622 ROCK1Q13464 1354 aa23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF25-208ENST00000616622 ABCC5O15440 1437 aa23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF25-208ENST00000616622 ARID3CA6NKF2 412 aa23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF25-208ENST00000616622 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.83■■□□□ 1.4
ARHGEF25-208ENST00000616622 TRIM52Q96A61 297 aa23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF25-208ENST00000616622 CEP170Q5SW79 1584 aa23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF25-208ENST00000616622 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF25-208ENST00000616622 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF25-208ENST00000616622 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.77■■□□□ 1.4
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