RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614051.1

CCL3-206, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3, Length 1,494 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3-206ENST00000614051 CHD1O14646 1710 aa25.36■■□□□ 1.65
CCL3-206ENST00000614051 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CCL3-206ENST00000614051 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.34■■□□□ 1.65
CCL3-206ENST00000614051 GRIN2AQ12879 1464 aa25.32■■□□□ 1.64
CCL3-206ENST00000614051 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CCL3-206ENST00000614051 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.21■■□□□ 1.63
CCL3-206ENST00000614051 CEP170Q5SW79 1584 aa25.21■■□□□ 1.63
CCL3-206ENST00000614051 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.18■■□□□ 1.62
CCL3-206ENST00000614051 NUP160Q12769 1436 aa25.16■■□□□ 1.62
CCL3-206ENST00000614051 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CCL3-206ENST00000614051 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.08■■□□□ 1.61
CCL3-206ENST00000614051 IQGAP2Q13576 1575 aa25.07■■□□□ 1.6
CCL3-206ENST00000614051 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.04■■□□□ 1.6
CCL3-206ENST00000614051 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.04■■□□□ 1.6
CCL3-206ENST00000614051 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.04■■□□□ 1.6
CCL3-206ENST00000614051 CEP162Q5TB80 1403 aa25.02■■□□□ 1.6
CCL3-206ENST00000614051 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.02■■□□□ 1.6
CCL3-206ENST00000614051 ARHGEF11O15085 1522 aa25■■□□□ 1.59
CCL3-206ENST00000614051 CLIP1P30622 1438 aa24.95■■□□□ 1.58
CCL3-206ENST00000614051 JPH4Q96JJ6 628 aa24.94■■□□□ 1.58
CCL3-206ENST00000614051 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.93■■□□□ 1.58
CCL3-206ENST00000614051 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.93■■□□□ 1.58
CCL3-206ENST00000614051 SHROOM2Q13796 1616 aa24.91■■□□□ 1.58
CCL3-206ENST00000614051 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.9■■□□□ 1.58
CCL3-206ENST00000614051 P3H3Q8IVL6 736 aa24.89■■□□□ 1.58
CCL3-206ENST00000614051 SAMD9Q5K651 1589 aa24.89■■□□□ 1.58
CCL3-206ENST00000614051 DISP1Q96F81 1524 aa24.86■■□□□ 1.57
CCL3-206ENST00000614051 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.85■■□□□ 1.57
CCL3-206ENST00000614051 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCL3-206ENST00000614051 KIAA0556O60303 1618 aa24.84■■□□□ 1.57
CCL3-206ENST00000614051 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.83■■□□□ 1.57
CCL3-206ENST00000614051 ARAP1Q96P48 1450 aa24.81■■□□□ 1.56
CCL3-206ENST00000614051 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.81■■□□□ 1.56
CCL3-206ENST00000614051 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.77■■□□□ 1.56
CCL3-206ENST00000614051 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CCL3-206ENST00000614051 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CCL3-206ENST00000614051 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.63■■□□□ 1.53
CCL3-206ENST00000614051 PTPRGP23470 1445 aa24.61■■□□□ 1.53
CCL3-206ENST00000614051 FMN1Q68DA7 1419 aa24.61■■□□□ 1.53
CCL3-206ENST00000614051 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CCL3-206ENST00000614051 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.55■■□□□ 1.52
CCL3-206ENST00000614051 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CCL3-206ENST00000614051 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.53■■□□□ 1.52
CCL3-206ENST00000614051 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.53■■□□□ 1.52
CCL3-206ENST00000614051 ABCA8O94911 1581 aa24.51■■□□□ 1.51
CCL3-206ENST00000614051 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.5■■□□□ 1.51
CCL3-206ENST00000614051 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.49■■□□□ 1.51
CCL3-206ENST00000614051 HECW1Q76N89 1606 aa24.46■■□□□ 1.51
CCL3-206ENST00000614051 UACAQ9BZF9 1416 aa24.46■■□□□ 1.51
CCL3-206ENST00000614051 ARID3CA6NKF2 412 aa24.45■■□□□ 1.51
CCL3-206ENST00000614051 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CCL3-206ENST00000614051 ABCC2Q92887 1545 aa24.41■■□□□ 1.5
CCL3-206ENST00000614051 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.41■■□□□ 1.5
CCL3-206ENST00000614051 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.37■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.36■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 TIAM1Q13009 1591 aa24.34■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 APLP2Q06481 763 aa24.34■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.34■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 ATP10BO94823 1461 aa24.33■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.33■■□□□ 1.49
CCL3-206ENST00000614051 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCL3-206ENST00000614051 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CCL3-206ENST00000614051 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CCL3-206ENST00000614051 MAP3K1Q13233 1512 aa24.29■■□□□ 1.48
CCL3-206ENST00000614051 ADRA2BP18089 450 aa24.29■■□□□ 1.48
CCL3-206ENST00000614051 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CCL3-206ENST00000614051 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.28■■□□□ 1.48
CCL3-206ENST00000614051 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.25■■□□□ 1.47
CCL3-206ENST00000614051 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.22■■□□□ 1.47
CCL3-206ENST00000614051 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.17■■□□□ 1.46
CCL3-206ENST00000614051 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
CCL3-206ENST00000614051 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CCL3-206ENST00000614051 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.15■■□□□ 1.46
CCL3-206ENST00000614051 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.14■■□□□ 1.46
CCL3-206ENST00000614051 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CCL3-206ENST00000614051 ASXL2Q76L83 1435 aa24.1■■□□□ 1.45
CCL3-206ENST00000614051 KIF14Q15058 1648 aa24.1■■□□□ 1.45
CCL3-206ENST00000614051 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCL3-206ENST00000614051 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.07■■□□□ 1.44
CCL3-206ENST00000614051 KCNH8Q96L42 1107 aa24.06■■□□□ 1.44
CCL3-206ENST00000614051 NCOA2Q15596 1464 aa24.04■■□□□ 1.44
CCL3-206ENST00000614051 MAPKBP1O60336 1514 aa24.04■■□□□ 1.44
CCL3-206ENST00000614051 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.98■■□□□ 1.43
CCL3-206ENST00000614051 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
CCL3-206ENST00000614051 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.97■■□□□ 1.43
CCL3-206ENST00000614051 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.97■■□□□ 1.43
CCL3-206ENST00000614051 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CCL3-206ENST00000614051 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.93■■□□□ 1.42
CCL3-206ENST00000614051 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.93■■□□□ 1.42
CCL3-206ENST00000614051 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.91■■□□□ 1.42
CCL3-206ENST00000614051 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.9■■□□□ 1.42
CCL3-206ENST00000614051 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CCL3-206ENST00000614051 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.88■■□□□ 1.41
CCL3-206ENST00000614051 DIP2BQ9P265 1576 aa23.88■■□□□ 1.41
CCL3-206ENST00000614051 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.88■■□□□ 1.41
CCL3-206ENST00000614051 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.87■■□□□ 1.41
CCL3-206ENST00000614051 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.87■■□□□ 1.41
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