RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.37□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FKBP8Q14318 412 aa6.37□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HMGXB3Q12766 1538 aa6.36□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NCAPD3P42695 1498 aa6.36□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.36□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NEFLP07196 543 aa6.35□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.35□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CFTRP13569 1480 aa6.34□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IGF1RP08069 1367 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANP32CO43423 234 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRDM2Q13029 1718 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MSH5O43196 834 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BCANQ96GW7 911 aa6.29□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.29□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.28□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.28□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.28□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.28□□□□□ -1.4
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HFM1A2PYH4 1435 aa6.27□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UACAQ9BZF9 1416 aa6.27□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.27□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ITGAEP38570 1179 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NCOA2Q15596 1464 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRIM52Q96A61 297 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TONSLQ96HA7 1378 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.23□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NAIPQ13075 1403 aa6.23□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AKNAQ7Z591 1439 aa6.23□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PTPRKQ15262 1439 aa6.22□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.21□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.21□□□□□ -1.41
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FMN1Q68DA7 1419 aa6.21□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.21□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.21□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.21□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.21□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CUL7Q14999 1698 aa6.2□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARHGEF11O15085 1522 aa6.2□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NCOA1Q15788 1441 aa6.2□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.2□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.2□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.2□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.19□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HECW1Q76N89 1606 aa6.19□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.19□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.18□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.18□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SAMD9Q5K651 1589 aa6.18□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.17□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GRIN2BQ13224 1484 aa6.17□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.17□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC7Q96M83 1385 aa6.17□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.16□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.16□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.16□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.16□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.15□□□□□ -1.42
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.15□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MIA2Q96PC5 1412 aa6.15□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC184Q52MB2 194 aa6.14□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ROCK1Q13464 1354 aa6.13□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.13□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.12□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 P3H3Q8IVL6 736 aa6.12□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TOPBP1Q92547 1522 aa6.12□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.12□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms