RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612467.1

PCDHGA3-202, Transcript of protocadherin gamma subfamily A, 3, humanhuman

TSL 2

Gene PCDHGA3, Length 2,712 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA3-202ENST00000612467 TIAM1Q13009 1591 aa20.86■□□□□ 0.93
PCDHGA3-202ENST00000612467 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PCDHGA3-202ENST00000612467 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.82■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.8■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.8■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 MIER1Q8N108 512 aa20.79■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.77■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.73■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.73■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 WDR97A6NE52 1622 aa20.73■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.71■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.71■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 CUL7Q14999 1698 aa20.71■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.69■□□□□ 0.9
PCDHGA3-202ENST00000612467 MAP3K1Q13233 1512 aa20.67■□□□□ 0.9
PCDHGA3-202ENST00000612467 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.67■□□□□ 0.9
PCDHGA3-202ENST00000612467 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.67■□□□□ 0.9
PCDHGA3-202ENST00000612467 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.63■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.63■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.62■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.61■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.61■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.6■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 ARID3CA6NKF2 412 aa20.6■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 MAPKBP1O60336 1514 aa20.59■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.59■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.58■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.56■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 FMN1Q68DA7 1419 aa20.54■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.53■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 SAMD9Q5K651 1589 aa20.51■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.47■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 PTPRKQ15262 1439 aa20.46■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 PBRM1Q86U86 1689 aa20.46■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 GRIN2BQ13224 1484 aa20.45■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.43■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 NCOA2Q15596 1464 aa20.42■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.42■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.39■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 ADAMTS12P58397 1594 aa20.37■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 IQGAP2Q13576 1575 aa20.35■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.34■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.34■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 KCNH8Q96L42 1107 aa20.32■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.32■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.29■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.27■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 FBLN2P98095 1184 aa20.27■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.26■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 NAIPQ13075 1403 aa20.26■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 IFT140Q96RY7 1462 aa20.25■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 HFM1A2PYH4 1435 aa20.25■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 ERCC6Q03468 1493 aa20.24■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 WDR62O43379 1518 aa20.24■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 HECW1Q76N89 1606 aa20.23■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 ARHGEF11O15085 1522 aa20.21■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 DISP1Q96F81 1524 aa20.19■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 UACAQ9BZF9 1416 aa20.18■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 KDM6BO15054 1643 aa20.18■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 TRIM52Q96A61 297 aa20.18■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 FOXD1Q16676 465 aa20.17■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 TONSLQ96HA7 1378 aa20.17■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 GRIN2AQ12879 1464 aa20.16■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 KIAA0556O60303 1618 aa20.14■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.14■□□□□ 0.81
PCDHGA3-202ENST00000612467 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PCDHGA3-202ENST00000612467 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PCDHGA3-202ENST00000612467 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PCDHGA3-202ENST00000612467 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.08■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 CEP170Q5SW79 1584 aa20.07■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.07■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.04■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.03■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.02■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.01■□□□□ 0.79
PCDHGA3-202ENST00000612467 MIA2Q96PC5 1412 aa20.01■□□□□ 0.79
PCDHGA3-202ENST00000612467 JPH4Q96JJ6 628 aa20.01■□□□□ 0.79
PCDHGA3-202ENST00000612467 SYNJ2O15056 1496 aa20■□□□□ 0.79
PCDHGA3-202ENST00000612467 DAPK1P53355 1430 aa19.99■□□□□ 0.79
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