RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612467.1

PCDHGA3-202, Transcript of protocadherin gamma subfamily A, 3, humanhuman

TSL 2

Gene PCDHGA3, Length 2,712 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA3-202ENST00000612467 TIAM1Q13009 1591 aa20.86■□□□□ 0.93
PCDHGA3-202ENST00000612467 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PCDHGA3-202ENST00000612467 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.82■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.8■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.8■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 MIER1Q8N108 512 aa20.79■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.77■□□□□ 0.92
PCDHGA3-202ENST00000612467 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.73■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.73■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 WDR97A6NE52 1622 aa20.73■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.71■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.71■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 CUL7Q14999 1698 aa20.71■□□□□ 0.91
PCDHGA3-202ENST00000612467 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.69■□□□□ 0.9
PCDHGA3-202ENST00000612467 MAP3K1Q13233 1512 aa20.67■□□□□ 0.9
PCDHGA3-202ENST00000612467 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.67■□□□□ 0.9
PCDHGA3-202ENST00000612467 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.67■□□□□ 0.9
PCDHGA3-202ENST00000612467 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.63■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.63■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.62■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.61■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.61■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.6■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 ARID3CA6NKF2 412 aa20.6■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 MAPKBP1O60336 1514 aa20.59■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.59■□□□□ 0.89
PCDHGA3-202ENST00000612467 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.58■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.56■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 FMN1Q68DA7 1419 aa20.54■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.53■□□□□ 0.88
PCDHGA3-202ENST00000612467 SAMD9Q5K651 1589 aa20.51■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.47■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 PTPRKQ15262 1439 aa20.46■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 PBRM1Q86U86 1689 aa20.46■□□□□ 0.87
PCDHGA3-202ENST00000612467 GRIN2BQ13224 1484 aa20.45■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.43■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 NCOA2Q15596 1464 aa20.42■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.42■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PCDHGA3-202ENST00000612467 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.39■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 ADAMTS12P58397 1594 aa20.37■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 IQGAP2Q13576 1575 aa20.35■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.34■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.34■□□□□ 0.85
PCDHGA3-202ENST00000612467 KCNH8Q96L42 1107 aa20.32■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.32■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.29■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.27■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 FBLN2P98095 1184 aa20.27■□□□□ 0.84
PCDHGA3-202ENST00000612467 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.26■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 NAIPQ13075 1403 aa20.26■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 IFT140Q96RY7 1462 aa20.25■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 HFM1A2PYH4 1435 aa20.25■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 ERCC6Q03468 1493 aa20.24■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 WDR62O43379 1518 aa20.24■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 HECW1Q76N89 1606 aa20.23■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 ARHGEF11O15085 1522 aa20.21■□□□□ 0.83
PCDHGA3-202ENST00000612467 DISP1Q96F81 1524 aa20.19■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 UACAQ9BZF9 1416 aa20.18■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 KDM6BO15054 1643 aa20.18■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 TRIM52Q96A61 297 aa20.18■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 FOXD1Q16676 465 aa20.17■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 TONSLQ96HA7 1378 aa20.17■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 GRIN2AQ12879 1464 aa20.16■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 KIAA0556O60303 1618 aa20.14■□□□□ 0.82
PCDHGA3-202ENST00000612467 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.14■□□□□ 0.81
PCDHGA3-202ENST00000612467 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PCDHGA3-202ENST00000612467 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PCDHGA3-202ENST00000612467 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PCDHGA3-202ENST00000612467 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.08■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 CEP170Q5SW79 1584 aa20.07■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.07■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.04■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.03■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.02■□□□□ 0.8
PCDHGA3-202ENST00000612467 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.01■□□□□ 0.79
PCDHGA3-202ENST00000612467 MIA2Q96PC5 1412 aa20.01■□□□□ 0.79
PCDHGA3-202ENST00000612467 JPH4Q96JJ6 628 aa20.01■□□□□ 0.79
PCDHGA3-202ENST00000612467 SYNJ2O15056 1496 aa20■□□□□ 0.79
PCDHGA3-202ENST00000612467 DAPK1P53355 1430 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 197.8 ms