RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607330.1

MEIS3-213, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 4

Gene MEIS3, Length 515 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-213ENST00000607330 SHROOM2Q13796 1616 aa30.09■■■□□ 2.41
MEIS3-213ENST00000607330 ARHGEF11O15085 1522 aa30.04■■■□□ 2.4
MEIS3-213ENST00000607330 IQGAP2Q13576 1575 aa30.02■■■□□ 2.4
MEIS3-213ENST00000607330 JPH4Q96JJ6 628 aa30.01■■■□□ 2.39
MEIS3-213ENST00000607330 GOLGA3Q08378 1498 aa29.98■■■□□ 2.39
MEIS3-213ENST00000607330 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.97■■■□□ 2.39
MEIS3-213ENST00000607330 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.96■■■□□ 2.39
MEIS3-213ENST00000607330 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.96■■■□□ 2.39
MEIS3-213ENST00000607330 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.96■■■□□ 2.39
MEIS3-213ENST00000607330 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-213ENST00000607330 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-213ENST00000607330 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.86■■■□□ 2.37
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MEIS3-213ENST00000607330 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.81■■■□□ 2.36
MEIS3-213ENST00000607330 DISP1Q96F81 1524 aa29.81■■■□□ 2.36
MEIS3-213ENST00000607330 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
MEIS3-213ENST00000607330 KIAA0556O60303 1618 aa29.73■■■□□ 2.35
MEIS3-213ENST00000607330 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.7■■■□□ 2.35
MEIS3-213ENST00000607330 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.69■■■□□ 2.34
MEIS3-213ENST00000607330 SAMD9Q5K651 1589 aa29.69■■■□□ 2.34
MEIS3-213ENST00000607330 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.67■■■□□ 2.34
MEIS3-213ENST00000607330 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.64■■■□□ 2.34
MEIS3-213ENST00000607330 PTPRGP23470 1445 aa29.62■■■□□ 2.33
MEIS3-213ENST00000607330 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.5■■■□□ 2.31
MEIS3-213ENST00000607330 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.5■■■□□ 2.31
MEIS3-213ENST00000607330 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
MEIS3-213ENST00000607330 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.47■■■□□ 2.31
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MEIS3-213ENST00000607330 P3H3Q8IVL6 736 aa29.46■■■□□ 2.31
MEIS3-213ENST00000607330 UACAQ9BZF9 1416 aa29.45■■■□□ 2.31
MEIS3-213ENST00000607330 CLIP1P30622 1438 aa29.43■■■□□ 2.3
MEIS3-213ENST00000607330 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-213ENST00000607330 ABCC2Q92887 1545 aa29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-213ENST00000607330 ABCA8O94911 1581 aa29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-213ENST00000607330 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-213ENST00000607330 CEP162Q5TB80 1403 aa29.38■■■□□ 2.29
MEIS3-213ENST00000607330 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.37■■■□□ 2.29
MEIS3-213ENST00000607330 FMN1Q68DA7 1419 aa29.35■■■□□ 2.29
MEIS3-213ENST00000607330 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.3■■■□□ 2.28
MEIS3-213ENST00000607330 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.28■■■□□ 2.28
MEIS3-213ENST00000607330 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
MEIS3-213ENST00000607330 MAPKBP1O60336 1514 aa29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-213ENST00000607330 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
MEIS3-213ENST00000607330 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
MEIS3-213ENST00000607330 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.16■■■□□ 2.26
MEIS3-213ENST00000607330 ATP10BO94823 1461 aa29.15■■■□□ 2.26
MEIS3-213ENST00000607330 HECW1Q76N89 1606 aa29.13■■■□□ 2.25
MEIS3-213ENST00000607330 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.1■■■□□ 2.25
MEIS3-213ENST00000607330 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
MEIS3-213ENST00000607330 ASXL2Q76L83 1435 aa29.09■■■□□ 2.25
MEIS3-213ENST00000607330 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
MEIS3-213ENST00000607330 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.04■■■□□ 2.24
MEIS3-213ENST00000607330 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.03■■■□□ 2.24
MEIS3-213ENST00000607330 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.02■■■□□ 2.24
MEIS3-213ENST00000607330 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29■■■□□ 2.23
MEIS3-213ENST00000607330 ARID3CA6NKF2 412 aa28.99■■■□□ 2.23
MEIS3-213ENST00000607330 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
MEIS3-213ENST00000607330 DIP2BQ9P265 1576 aa28.96■■■□□ 2.23
MEIS3-213ENST00000607330 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
MEIS3-213ENST00000607330 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.94■■■□□ 2.22
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MEIS3-213ENST00000607330 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
MEIS3-213ENST00000607330 GLI2P10070 1586 aa28.92■■■□□ 2.22
MEIS3-213ENST00000607330 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.9■■■□□ 2.22
MEIS3-213ENST00000607330 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
MEIS3-213ENST00000607330 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
MEIS3-213ENST00000607330 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.87■■■□□ 2.21
MEIS3-213ENST00000607330 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.87■■■□□ 2.21
MEIS3-213ENST00000607330 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
MEIS3-213ENST00000607330 MAP3K1Q13233 1512 aa28.8■■■□□ 2.2
MEIS3-213ENST00000607330 KCNH8Q96L42 1107 aa28.79■■■□□ 2.2
MEIS3-213ENST00000607330 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-213ENST00000607330 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.76■■■□□ 2.2
MEIS3-213ENST00000607330 TIAM1Q13009 1591 aa28.76■■■□□ 2.19
MEIS3-213ENST00000607330 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.76■■■□□ 2.19
MEIS3-213ENST00000607330 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.76■■■□□ 2.19
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MEIS3-213ENST00000607330 KIF14Q15058 1648 aa28.7■■■□□ 2.19
MEIS3-213ENST00000607330 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.69■■■□□ 2.18
MEIS3-213ENST00000607330 CD109Q6YHK3 1445 aa28.69■■■□□ 2.18
MEIS3-213ENST00000607330 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.67■■■□□ 2.18
MEIS3-213ENST00000607330 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.64■■■□□ 2.18
MEIS3-213ENST00000607330 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.64■■■□□ 2.17
MEIS3-213ENST00000607330 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
MEIS3-213ENST00000607330 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.62■■■□□ 2.17
MEIS3-213ENST00000607330 APLP2Q06481 763 aa28.61■■■□□ 2.17
MEIS3-213ENST00000607330 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.58■■■□□ 2.17
MEIS3-213ENST00000607330 PLCH2O75038 1416 aa28.57■■■□□ 2.16
MEIS3-213ENST00000607330 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
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MEIS3-213ENST00000607330 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
MEIS3-213ENST00000607330 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.5■■■□□ 2.15
MEIS3-213ENST00000607330 NCOA2Q15596 1464 aa28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-213ENST00000607330 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
MEIS3-213ENST00000607330 PREX2Q70Z35 1606 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-213ENST00000607330 FANCAO15360 1455 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-213ENST00000607330 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.45■■■□□ 2.15
MEIS3-213ENST00000607330 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.45■■■□□ 2.14
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