RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604434.1

TAF15-209, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 15, human

Gene TAF15, Length 2,103 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF15-209	ENST00000604434	CUL7	Q14999	1698 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TAF15-209	ENST00000604434	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
TAF15-209	ENST00000604434	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
TAF15-209	ENST00000604434	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TAF15-209	ENST00000604434	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TAF15-209	ENST00000604434	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TAF15-209	ENST00000604434	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
TAF15-209	ENST00000604434	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TAF15-209	ENST00000604434	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TAF15-209	ENST00000604434	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TAF15-209	ENST00000604434	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TAF15-209	ENST00000604434	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.92	■■■□□ 2.22	1e-6	■■□□□ 11.6
TAF15-209	ENST00000604434	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TAF15-209	ENST00000604434	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TAF15-209	ENST00000604434	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TAF15-209	ENST00000604434	ITGAE	P38570	1179 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TAF15-209	ENST00000604434	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TAF15-209	ENST00000604434	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TAF15-209	ENST00000604434	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TAF15-209	ENST00000604434	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.81	■■■□□ 2.2	4e-6	■□□□□ 8.2
TAF15-209	ENST00000604434	NES	P48681	1621 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TAF15-209	ENST00000604434	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TAF15-209	ENST00000604434	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TAF15-209	ENST00000604434	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TAF15-209	ENST00000604434	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TAF15-209	ENST00000604434	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
TAF15-209	ENST00000604434	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
TAF15-209	ENST00000604434	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TAF15-209	ENST00000604434	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TAF15-209	ENST00000604434	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TAF15-209	ENST00000604434	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
TAF15-209	ENST00000604434	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.64	■■■□□ 2.17
TAF15-209	ENST00000604434	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
TAF15-209	ENST00000604434	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TAF15-209	ENST00000604434	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TAF15-209	ENST00000604434	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TAF15-209	ENST00000604434	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
TAF15-209	ENST00000604434	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TAF15-209	ENST00000604434	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TAF15-209	ENST00000604434	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TAF15-209	ENST00000604434	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
TAF15-209	ENST00000604434	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
TAF15-209	ENST00000604434	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TAF15-209	ENST00000604434	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TAF15-209	ENST00000604434	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TAF15-209	ENST00000604434	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TAF15-209	ENST00000604434	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TAF15-209	ENST00000604434	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TAF15-209	ENST00000604434	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TAF15-209	ENST00000604434	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TAF15-209	ENST00000604434	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.38	■■■□□ 2.13
TAF15-209	ENST00000604434	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.38	■■■□□ 2.13
TAF15-209	ENST00000604434	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
TAF15-209	ENST00000604434	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.35	■■■□□ 2.13
TAF15-209	ENST00000604434	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.35	■■■□□ 2.13
TAF15-209	ENST00000604434	NAIP	Q13075	1403 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TAF15-209	ENST00000604434	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TAF15-209	ENST00000604434	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
TAF15-209	ENST00000604434	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TAF15-209	ENST00000604434	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TAF15-209	ENST00000604434	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TAF15-209	ENST00000604434	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
TAF15-209	ENST00000604434	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TAF15-209	ENST00000604434	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
TAF15-209	ENST00000604434	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TAF15-209	ENST00000604434	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TAF15-209	ENST00000604434	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TAF15-209	ENST00000604434	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
TAF15-209	ENST00000604434	MYT1	Q01538	1121 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TAF15-209	ENST00000604434	CCER2	I3L3R5	266 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TAF15-209	ENST00000604434	WDR62	O43379	1518 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TAF15-209	ENST00000604434	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.14	■■■□□ 2.09
TAF15-209	ENST00000604434	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TAF15-209	ENST00000604434	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TAF15-209	ENST00000604434	ANP32C	O43423	234 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TAF15-209	ENST00000604434	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
TAF15-209	ENST00000604434	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
TAF15-209	ENST00000604434	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
TAF15-209	ENST00000604434	KDM6B	O15054	1643 aa		28	■■■□□ 2.07
TAF15-209	ENST00000604434	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28	■■■□□ 2.07
TAF15-209	ENST00000604434	KIAA0556	O60303	1618 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TAF15-209	ENST00000604434	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TAF15-209	ENST00000604434	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
TAF15-209	ENST00000604434	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TAF15-209	ENST00000604434	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TAF15-209	ENST00000604434	ROCK1	Q13464	1354 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TAF15-209	ENST00000604434	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TAF15-209	ENST00000604434	DISP1	Q96F81	1524 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TAF15-209	ENST00000604434	DAPK1	P53355	1430 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TAF15-209	ENST00000604434	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TAF15-209	ENST00000604434	TRIM52	Q96A61	297 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TAF15-209	ENST00000604434	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TAF15-209	ENST00000604434	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TAF15-209	ENST00000604434	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TAF15-209	ENST00000604434	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.83	■■■□□ 2.04
TAF15-209	ENST00000604434	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TAF15-209	ENST00000604434	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TAF15-209	ENST00000604434	FKBP8	Q14318	412 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TAF15-209	ENST00000604434	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TAF15-209	ENST00000604434	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.78	■■■□□ 2.04

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