RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.53■□□□□ 0.08
FCHO1-216ENST00000596536 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
FCHO1-216ENST00000596536 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.51■□□□□ 0.07
FCHO1-216ENST00000596536 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
FCHO1-216ENST00000596536 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.5■□□□□ 0.07
FCHO1-216ENST00000596536 IGF1RP08069 1367 aa15.5■□□□□ 0.07
FCHO1-216ENST00000596536 WDR97A6NE52 1622 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-216ENST00000596536 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-216ENST00000596536 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-216ENST00000596536 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.46■□□□□ 0.06
FCHO1-216ENST00000596536 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-216ENST00000596536 ARID3CA6NKF2 412 aa15.42■□□□□ 0.06
FCHO1-216ENST00000596536 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-216ENST00000596536 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-216ENST00000596536 CUL7Q14999 1698 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-216ENST00000596536 FBLN2P98095 1184 aa15.39■□□□□ 0.06
FCHO1-216ENST00000596536 KCNH8Q96L42 1107 aa15.39■□□□□ 0.06
FCHO1-216ENST00000596536 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-216ENST00000596536 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-216ENST00000596536 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-216ENST00000596536 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-216ENST00000596536 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-216ENST00000596536 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-216ENST00000596536 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
FCHO1-216ENST00000596536 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
FCHO1-216ENST00000596536 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.34■□□□□ 0.05
FCHO1-216ENST00000596536 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.32■□□□□ 0.04
FCHO1-216ENST00000596536 BCANQ96GW7 911 aa15.3■□□□□ 0.04
FCHO1-216ENST00000596536 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
FCHO1-216ENST00000596536 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.3■□□□□ 0.04
FCHO1-216ENST00000596536 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.29■□□□□ 0.04
FCHO1-216ENST00000596536 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.28■□□□□ 0.04
FCHO1-216ENST00000596536 WDR62O43379 1518 aa15.28■□□□□ 0.04
FCHO1-216ENST00000596536 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-216ENST00000596536 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-216ENST00000596536 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-216ENST00000596536 PBRM1Q86U86 1689 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-216ENST00000596536 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-216ENST00000596536 TIAM1Q13009 1591 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-216ENST00000596536 MAPKBP1O60336 1514 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-216ENST00000596536 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.21■□□□□ 0.03
FCHO1-216ENST00000596536 MAP3K1Q13233 1512 aa15.2■□□□□ 0.02
FCHO1-216ENST00000596536 IFT140Q96RY7 1462 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-216ENST00000596536 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-216ENST00000596536 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-216ENST00000596536 ADAMTS12P58397 1594 aa15.15■□□□□ 0.02
FCHO1-216ENST00000596536 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
FCHO1-216ENST00000596536 ERCC6Q03468 1493 aa15.14■□□□□ 0.01
FCHO1-216ENST00000596536 GRIN2BQ13224 1484 aa15.13■□□□□ 0.01
FCHO1-216ENST00000596536 SAMD9Q5K651 1589 aa15.13■□□□□ 0.01
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM52Q96A61 297 aa15.13■□□□□ 0.01
FCHO1-216ENST00000596536 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 28.6
FCHO1-216ENST00000596536 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.11■□□□□ 0.01
FCHO1-216ENST00000596536 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.09■□□□□ 0.01
FCHO1-216ENST00000596536 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.09■□□□□ 0.01
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
FCHO1-216ENST00000596536 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.08■□□□□ 0
FCHO1-216ENST00000596536 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
FCHO1-216ENST00000596536 FKBP8Q14318 412 aa15.08■□□□□ 0
FCHO1-216ENST00000596536 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.06■□□□□ 0
FCHO1-216ENST00000596536 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.05■□□□□ 0
FCHO1-216ENST00000596536 TONSLQ96HA7 1378 aa15.05■□□□□ -0
FCHO1-216ENST00000596536 FMN1Q68DA7 1419 aa15.05■□□□□ -0
FCHO1-216ENST00000596536 ANP32CO43423 234 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-216ENST00000596536 IQGAP2Q13576 1575 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-216ENST00000596536 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-216ENST00000596536 PTPRKQ15262 1439 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-216ENST00000596536 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-216ENST00000596536 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
FCHO1-216ENST00000596536 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.98□□□□□ -0.01
FCHO1-216ENST00000596536 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.97□□□□□ -0.01
FCHO1-216ENST00000596536 FOXD1Q16676 465 aa14.97□□□□□ -0.01
FCHO1-216ENST00000596536 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.96□□□□□ -0.01
FCHO1-216ENST00000596536 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
FCHO1-216ENST00000596536 GRIN2AQ12879 1464 aa14.96□□□□□ -0.01
FCHO1-216ENST00000596536 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.94□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.94□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 NEFLP07196 543 aa14.93□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 NCOA2Q15596 1464 aa14.93□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 MSH5O43196 834 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 SYNJ2O15056 1496 aa14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 NAIPQ13075 1403 aa14.9□□□□□ -0.02
FCHO1-216ENST00000596536 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.029e-6■□□□□ 9.6
FCHO1-216ENST00000596536 HFM1A2PYH4 1435 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 KIAA0556O60303 1618 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 HECW1Q76N89 1606 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 UACAQ9BZF9 1416 aa14.89□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 CEP170Q5SW79 1584 aa14.88□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 DISP1Q96F81 1524 aa14.87□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 CCER2I3L3R5 266 aa14.87□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.85□□□□□ -0.03
FCHO1-216ENST00000596536 NUP160Q12769 1436 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms