RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595357.5

STRN4-211, Transcript of striatin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STRN4, Length 1,602 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4-211ENST00000595357 WDR97A6NE52 1622 aa23.88■■□□□ 1.41
STRN4-211ENST00000595357 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
STRN4-211ENST00000595357 MIER1Q8N108 512 aa23.87■■□□□ 1.41
STRN4-211ENST00000595357 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.86■■□□□ 1.41
STRN4-211ENST00000595357 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.85■■□□□ 1.41
STRN4-211ENST00000595357 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.83■■□□□ 1.41
STRN4-211ENST00000595357 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.83■■□□□ 1.4
STRN4-211ENST00000595357 TOPBP1Q92547 1522 aa23.81■■□□□ 1.4
STRN4-211ENST00000595357 MAPKBP1O60336 1514 aa23.78■■□□□ 1.4
STRN4-211ENST00000595357 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.39
STRN4-211ENST00000595357 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.391e-7■■■■■ 37.6
STRN4-211ENST00000595357 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.75■■□□□ 1.39
STRN4-211ENST00000595357 ERCC6Q03468 1493 aa23.73■■□□□ 1.39
STRN4-211ENST00000595357 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.71■■□□□ 1.39
STRN4-211ENST00000595357 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.7■■□□□ 1.39
STRN4-211ENST00000595357 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.7■■□□□ 1.38
STRN4-211ENST00000595357 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.68■■□□□ 1.38
STRN4-211ENST00000595357 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.68■■□□□ 1.38
STRN4-211ENST00000595357 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.67■■□□□ 1.38
STRN4-211ENST00000595357 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.66■■□□□ 1.38
STRN4-211ENST00000595357 SAMD9Q5K651 1589 aa23.64■■□□□ 1.38
STRN4-211ENST00000595357 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
STRN4-211ENST00000595357 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.372e-6■■□□□ 12
STRN4-211ENST00000595357 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.63■■□□□ 1.37
STRN4-211ENST00000595357 NESP48681 1621 aa23.62■■□□□ 1.37
STRN4-211ENST00000595357 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.62■■□□□ 1.37
STRN4-211ENST00000595357 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.61■■□□□ 1.37
STRN4-211ENST00000595357 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
STRN4-211ENST00000595357 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.58■■□□□ 1.37
STRN4-211ENST00000595357 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
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STRN4-211ENST00000595357 ITGAEP38570 1179 aa23.49■■□□□ 1.35
STRN4-211ENST00000595357 GRIN2BQ13224 1484 aa23.45■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.44■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 PBRM1Q86U86 1689 aa23.43■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.42■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 P3H3Q8IVL6 736 aa23.41■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.41■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.4■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.39■■□□□ 1.34
STRN4-211ENST00000595357 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
STRN4-211ENST00000595357 ARHGEF11O15085 1522 aa23.37■■□□□ 1.33
STRN4-211ENST00000595357 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.36■■□□□ 1.33
STRN4-211ENST00000595357 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.33■■□□□ 1.33
STRN4-211ENST00000595357 HFM1A2PYH4 1435 aa23.32■■□□□ 1.32
STRN4-211ENST00000595357 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.32■■□□□ 1.32
STRN4-211ENST00000595357 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.32■■□□□ 1.32
STRN4-211ENST00000595357 NCOA2Q15596 1464 aa23.3■■□□□ 1.32
STRN4-211ENST00000595357 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.3■■□□□ 1.32
STRN4-211ENST00000595357 HECW1Q76N89 1606 aa23.28■■□□□ 1.32
STRN4-211ENST00000595357 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.27■■□□□ 1.32
STRN4-211ENST00000595357 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
STRN4-211ENST00000595357 ADAMTS12P58397 1594 aa23.27■■□□□ 1.32
STRN4-211ENST00000595357 PTPRKQ15262 1439 aa23.27■■□□□ 1.31
STRN4-211ENST00000595357 UACAQ9BZF9 1416 aa23.27■■□□□ 1.31
STRN4-211ENST00000595357 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.26■■□□□ 1.31
STRN4-211ENST00000595357 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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STRN4-211ENST00000595357 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.24■■□□□ 1.31
STRN4-211ENST00000595357 IQGAP2Q13576 1575 aa23.23■■□□□ 1.31
STRN4-211ENST00000595357 NAIPQ13075 1403 aa23.22■■□□□ 1.31
STRN4-211ENST00000595357 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
STRN4-211ENST00000595357 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.17■■□□□ 1.3
STRN4-211ENST00000595357 AKNAQ7Z591 1439 aa23.17■■□□□ 1.3
STRN4-211ENST00000595357 WDR62O43379 1518 aa23.16■■□□□ 1.3
STRN4-211ENST00000595357 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
STRN4-211ENST00000595357 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
STRN4-211ENST00000595357 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.08■■□□□ 1.29
STRN4-211ENST00000595357 TONSLQ96HA7 1378 aa23.08■■□□□ 1.28
STRN4-211ENST00000595357 MIA2Q96PC5 1412 aa23.06■■□□□ 1.28
STRN4-211ENST00000595357 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
STRN4-211ENST00000595357 KCNH8Q96L42 1107 aa23.04■■□□□ 1.28
STRN4-211ENST00000595357 KDM6BO15054 1643 aa23.04■■□□□ 1.28
STRN4-211ENST00000595357 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
STRN4-211ENST00000595357 CCER2I3L3R5 266 aa23.03■■□□□ 1.28
STRN4-211ENST00000595357 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
STRN4-211ENST00000595357 KIAA0556O60303 1618 aa23.01■■□□□ 1.27
STRN4-211ENST00000595357 MYT1Q01538 1121 aa22.99■■□□□ 1.27
STRN4-211ENST00000595357 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
STRN4-211ENST00000595357 IFT140Q96RY7 1462 aa22.96■■□□□ 1.27
STRN4-211ENST00000595357 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
STRN4-211ENST00000595357 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.94■■□□□ 1.26
STRN4-211ENST00000595357 DISP1Q96F81 1524 aa22.91■■□□□ 1.26
STRN4-211ENST00000595357 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.91■■□□□ 1.26
STRN4-211ENST00000595357 ANP32CO43423 234 aa22.89■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.89■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 ROCK1Q13464 1354 aa22.88■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.87■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.87■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.84■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 DAPK1P53355 1430 aa22.84■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
STRN4-211ENST00000595357 GRIN2AQ12879 1464 aa22.82■■□□□ 1.24
STRN4-211ENST00000595357 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.82■■□□□ 1.24
STRN4-211ENST00000595357 ABCC5O15440 1437 aa22.78■■□□□ 1.24
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