RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593586.1

TTC9B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

Gene TTC9B, Length 2,323 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-202ENST00000593586 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.37■■■□□ 2.29
TTC9B-202ENST00000593586 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.37■■■□□ 2.29
TTC9B-202ENST00000593586 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.34■■■□□ 2.29
TTC9B-202ENST00000593586 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.33■■■□□ 2.29
TTC9B-202ENST00000593586 TOPBP1Q92547 1522 aa29.32■■■□□ 2.28
TTC9B-202ENST00000593586 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.32■■■□□ 2.28
TTC9B-202ENST00000593586 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
TTC9B-202ENST00000593586 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
TTC9B-202ENST00000593586 P3H3Q8IVL6 736 aa29.28■■■□□ 2.28
TTC9B-202ENST00000593586 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.27■■■□□ 2.28
TTC9B-202ENST00000593586 MAPKBP1O60336 1514 aa29.27■■■□□ 2.28
TTC9B-202ENST00000593586 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.25■■■□□ 2.27
TTC9B-202ENST00000593586 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.24■■■□□ 2.27
TTC9B-202ENST00000593586 NESP48681 1621 aa29.23■■■□□ 2.27
TTC9B-202ENST00000593586 CUL7Q14999 1698 aa29.23■■■□□ 2.27
TTC9B-202ENST00000593586 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.21■■■□□ 2.27
TTC9B-202ENST00000593586 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
TTC9B-202ENST00000593586 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TTC9B-202ENST00000593586 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.17■■■□□ 2.26
TTC9B-202ENST00000593586 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
TTC9B-202ENST00000593586 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.15■■■□□ 2.26
TTC9B-202ENST00000593586 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC9B-202ENST00000593586 WDR97A6NE52 1622 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC9B-202ENST00000593586 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
TTC9B-202ENST00000593586 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TTC9B-202ENST00000593586 FMN1Q68DA7 1419 aa29.07■■■□□ 2.24
TTC9B-202ENST00000593586 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29■■■□□ 2.23
TTC9B-202ENST00000593586 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.98■■■□□ 2.23
TTC9B-202ENST00000593586 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.98■■■□□ 2.23
TTC9B-202ENST00000593586 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TTC9B-202ENST00000593586 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.95■■■□□ 2.22
TTC9B-202ENST00000593586 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.95■■■□□ 2.22
TTC9B-202ENST00000593586 SAMD9Q5K651 1589 aa28.94■■■□□ 2.22
TTC9B-202ENST00000593586 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.93■■■□□ 2.22
TTC9B-202ENST00000593586 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.9■■■□□ 2.22
TTC9B-202ENST00000593586 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.9■■■□□ 2.22
TTC9B-202ENST00000593586 GRIN2BQ13224 1484 aa28.84■■■□□ 2.21
TTC9B-202ENST00000593586 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.82■■■□□ 2.2
TTC9B-202ENST00000593586 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
TTC9B-202ENST00000593586 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
TTC9B-202ENST00000593586 HFM1A2PYH4 1435 aa28.79■■■□□ 2.2
TTC9B-202ENST00000593586 NCOA2Q15596 1464 aa28.78■■■□□ 2.2
TTC9B-202ENST00000593586 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.78■■■□□ 2.2
TTC9B-202ENST00000593586 PTPRKQ15262 1439 aa28.78■■■□□ 2.2
TTC9B-202ENST00000593586 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.77■■■□□ 2.2
TTC9B-202ENST00000593586 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.76■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.74■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.74■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.73■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 UACAQ9BZF9 1416 aa28.73■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 KCNH8Q96L42 1107 aa28.72■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
TTC9B-202ENST00000593586 NAIPQ13075 1403 aa28.68■■■□□ 2.18
TTC9B-202ENST00000593586 TONSLQ96HA7 1378 aa28.66■■■□□ 2.18
TTC9B-202ENST00000593586 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.66■■■□□ 2.18
TTC9B-202ENST00000593586 ARHGEF11O15085 1522 aa28.64■■■□□ 2.18
TTC9B-202ENST00000593586 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.61■■■□□ 2.17
TTC9B-202ENST00000593586 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
TTC9B-202ENST00000593586 PBRM1Q86U86 1689 aa28.59■■■□□ 2.17
TTC9B-202ENST00000593586 HECW1Q76N89 1606 aa28.57■■■□□ 2.16
TTC9B-202ENST00000593586 IQGAP2Q13576 1575 aa28.55■■■□□ 2.16
TTC9B-202ENST00000593586 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TTC9B-202ENST00000593586 ADAMTS12P58397 1594 aa28.52■■■□□ 2.16
TTC9B-202ENST00000593586 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TTC9B-202ENST00000593586 CCER2I3L3R5 266 aa28.49■■■□□ 2.15
TTC9B-202ENST00000593586 ANP32CO43423 234 aa28.48■■■□□ 2.15
TTC9B-202ENST00000593586 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.46■■■□□ 2.15
TTC9B-202ENST00000593586 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.46■■■□□ 2.15
TTC9B-202ENST00000593586 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.45■■■□□ 2.14
TTC9B-202ENST00000593586 AKNAQ7Z591 1439 aa28.44■■■□□ 2.14
TTC9B-202ENST00000593586 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.44■■■□□ 2.14
TTC9B-202ENST00000593586 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.43■■■□□ 2.14
TTC9B-202ENST00000593586 WDR62O43379 1518 aa28.43■■■□□ 2.14
TTC9B-202ENST00000593586 MIA2Q96PC5 1412 aa28.42■■■□□ 2.14
TTC9B-202ENST00000593586 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
TTC9B-202ENST00000593586 MYT1Q01538 1121 aa28.37■■■□□ 2.13
TTC9B-202ENST00000593586 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TTC9B-202ENST00000593586 TRIM52Q96A61 297 aa28.34■■■□□ 2.13
TTC9B-202ENST00000593586 KDM6BO15054 1643 aa28.33■■■□□ 2.13
TTC9B-202ENST00000593586 ARID3CA6NKF2 412 aa28.3■■■□□ 2.12
TTC9B-202ENST00000593586 IFT140Q96RY7 1462 aa28.29■■■□□ 2.12
TTC9B-202ENST00000593586 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TTC9B-202ENST00000593586 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.26■■■□□ 2.12
TTC9B-202ENST00000593586 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.26■■■□□ 2.11
TTC9B-202ENST00000593586 KIAA0556O60303 1618 aa28.24■■■□□ 2.11
TTC9B-202ENST00000593586 DISP1Q96F81 1524 aa28.24■■■□□ 2.11
TTC9B-202ENST00000593586 FKBP8Q14318 412 aa28.23■■■□□ 2.11
TTC9B-202ENST00000593586 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.21■■■□□ 2.11
TTC9B-202ENST00000593586 ROCK1Q13464 1354 aa28.21■■■□□ 2.11
TTC9B-202ENST00000593586 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TTC9B-202ENST00000593586 DAPK1P53355 1430 aa28.21■■■□□ 2.11
TTC9B-202ENST00000593586 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TTC9B-202ENST00000593586 BCANQ96GW7 911 aa28.17■■■□□ 2.1
TTC9B-202ENST00000593586 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.17■■■□□ 2.1
TTC9B-202ENST00000593586 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TTC9B-202ENST00000593586 ABCC5O15440 1437 aa28.15■■■□□ 2.1
TTC9B-202ENST00000593586 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
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