RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593172.5

PALM-210, Transcript of paralemmin, humanhuman

TSL 2

Gene PALM, Length 2,489 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM-210ENST00000593172 TOPBP1Q92547 1522 aa29.33■■■□□ 2.29
PALM-210ENST00000593172 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
PALM-210ENST00000593172 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.28■■■□□ 2.28
PALM-210ENST00000593172 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.27■■■□□ 2.28
PALM-210ENST00000593172 MAP3K1Q13233 1512 aa29.27■■■□□ 2.28
PALM-210ENST00000593172 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PALM-210ENST00000593172 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.24■■■□□ 2.27
PALM-210ENST00000593172 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.22■■■□□ 2.27
PALM-210ENST00000593172 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PALM-210ENST00000593172 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.21■■■□□ 2.27
PALM-210ENST00000593172 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.19■■■□□ 2.26
PALM-210ENST00000593172 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.17■■■□□ 2.26
PALM-210ENST00000593172 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
PALM-210ENST00000593172 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PALM-210ENST00000593172 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.11■■■□□ 2.25
PALM-210ENST00000593172 MAPKBP1O60336 1514 aa29.1■■■□□ 2.25
PALM-210ENST00000593172 CUL7Q14999 1698 aa29.1■■■□□ 2.25
PALM-210ENST00000593172 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.08■■■□□ 2.25
PALM-210ENST00000593172 WDR97A6NE52 1622 aa29.06■■■□□ 2.24
PALM-210ENST00000593172 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.05■■■□□ 2.24
PALM-210ENST00000593172 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.05■■■□□ 2.24
PALM-210ENST00000593172 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PALM-210ENST00000593172 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.03■■■□□ 2.24
PALM-210ENST00000593172 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.02■■■□□ 2.24
PALM-210ENST00000593172 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.01■■■□□ 2.23
PALM-210ENST00000593172 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.95■■■□□ 2.23
PALM-210ENST00000593172 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.227e-6■■□□□ 13.1
PALM-210ENST00000593172 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.93■■■□□ 2.22
PALM-210ENST00000593172 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.91■■■□□ 2.22
PALM-210ENST00000593172 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.9■■■□□ 2.22
PALM-210ENST00000593172 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.88■■■□□ 2.21
PALM-210ENST00000593172 FMN1Q68DA7 1419 aa28.87■■■□□ 2.21
PALM-210ENST00000593172 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.86■■■□□ 2.21
PALM-210ENST00000593172 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.85■■■□□ 2.21
PALM-210ENST00000593172 SAMD9Q5K651 1589 aa28.83■■■□□ 2.21
PALM-210ENST00000593172 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.79■■■□□ 2.2
PALM-210ENST00000593172 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.78■■■□□ 2.2
PALM-210ENST00000593172 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
PALM-210ENST00000593172 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PALM-210ENST00000593172 GRIN2BQ13224 1484 aa28.73■■■□□ 2.19
PALM-210ENST00000593172 PTPRKQ15262 1439 aa28.73■■■□□ 2.19
PALM-210ENST00000593172 NCOA2Q15596 1464 aa28.67■■■□□ 2.18
PALM-210ENST00000593172 KCNH8Q96L42 1107 aa28.65■■■□□ 2.18
PALM-210ENST00000593172 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.62■■■□□ 2.17
PALM-210ENST00000593172 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.62■■■□□ 2.17
PALM-210ENST00000593172 PBRM1Q86U86 1689 aa28.61■■■□□ 2.17
PALM-210ENST00000593172 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PALM-210ENST00000593172 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.61■■■□□ 2.17
PALM-210ENST00000593172 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
PALM-210ENST00000593172 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.58■■■□□ 2.17
PALM-210ENST00000593172 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PALM-210ENST00000593172 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PALM-210ENST00000593172 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PALM-210ENST00000593172 HFM1A2PYH4 1435 aa28.57■■■□□ 2.16
PALM-210ENST00000593172 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.56■■■□□ 2.16
PALM-210ENST00000593172 MYT1Q01538 1121 aa28.54■■■□□ 2.16
PALM-210ENST00000593172 NAIPQ13075 1403 aa28.53■■■□□ 2.16
PALM-210ENST00000593172 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.53■■■□□ 2.16
PALM-210ENST00000593172 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.52■■■□□ 2.16
PALM-210ENST00000593172 ADAMTS12P58397 1594 aa28.5■■■□□ 2.15
PALM-210ENST00000593172 UACAQ9BZF9 1416 aa28.49■■■□□ 2.15
PALM-210ENST00000593172 ARID3CA6NKF2 412 aa28.49■■■□□ 2.15
PALM-210ENST00000593172 IQGAP2Q13576 1575 aa28.49■■■□□ 2.15
PALM-210ENST00000593172 ARHGEF11O15085 1522 aa28.49■■■□□ 2.15
PALM-210ENST00000593172 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.45■■■□□ 2.14
PALM-210ENST00000593172 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.44■■■□□ 2.14
PALM-210ENST00000593172 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PALM-210ENST00000593172 TONSLQ96HA7 1378 aa28.44■■■□□ 2.14
PALM-210ENST00000593172 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.44■■■□□ 2.14
PALM-210ENST00000593172 HECW1Q76N89 1606 aa28.43■■■□□ 2.14
PALM-210ENST00000593172 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PALM-210ENST00000593172 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PALM-210ENST00000593172 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PALM-210ENST00000593172 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PALM-210ENST00000593172 WDR62O43379 1518 aa28.35■■■□□ 2.13
PALM-210ENST00000593172 KDM6BO15054 1643 aa28.33■■■□□ 2.13
PALM-210ENST00000593172 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.3■■■□□ 2.12
PALM-210ENST00000593172 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PALM-210ENST00000593172 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.28■■■□□ 2.12
PALM-210ENST00000593172 IFT140Q96RY7 1462 aa28.25■■■□□ 2.11
PALM-210ENST00000593172 TRIM52Q96A61 297 aa28.25■■■□□ 2.11
PALM-210ENST00000593172 DISP1Q96F81 1524 aa28.22■■■□□ 2.11
PALM-210ENST00000593172 KIAA0556O60303 1618 aa28.2■■■□□ 2.11
PALM-210ENST00000593172 MIA2Q96PC5 1412 aa28.2■■■□□ 2.1
PALM-210ENST00000593172 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.18■■■□□ 2.1
PALM-210ENST00000593172 ANP32CO43423 234 aa28.17■■■□□ 2.1
PALM-210ENST00000593172 FOXD1Q16676 465 aa28.16■■■□□ 2.1
PALM-210ENST00000593172 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PALM-210ENST00000593172 AKNAQ7Z591 1439 aa28.15■■■□□ 2.1
PALM-210ENST00000593172 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PALM-210ENST00000593172 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PALM-210ENST00000593172 GRIN2AQ12879 1464 aa28.13■■■□□ 2.09
PALM-210ENST00000593172 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.13■■■□□ 2.09
PALM-210ENST00000593172 CCER2I3L3R5 266 aa28.1■■■□□ 2.09
PALM-210ENST00000593172 DAPK1P53355 1430 aa28.09■■■□□ 2.09
PALM-210ENST00000593172 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.09■■■□□ 2.09
PALM-210ENST00000593172 ABCC5O15440 1437 aa28.06■■■□□ 2.08
PALM-210ENST00000593172 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
PALM-210ENST00000593172 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
PALM-210ENST00000593172 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.02■■■□□ 2.08
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