RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593024.1

UBXN6-210, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-210ENST00000593024 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.47■■□□□ 1.99
UBXN6-210ENST00000593024 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN6-210ENST00000593024 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN6-210ENST00000593024 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
UBXN6-210ENST00000593024 IQGAP2Q13576 1575 aa27.39■■□□□ 1.97
UBXN6-210ENST00000593024 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.37■■□□□ 1.97
UBXN6-210ENST00000593024 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN6-210ENST00000593024 SHROOM2Q13796 1616 aa27.3■■□□□ 1.96
UBXN6-210ENST00000593024 JPH4Q96JJ6 628 aa27.3■■□□□ 1.96
UBXN6-210ENST00000593024 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.27■■□□□ 1.96
UBXN6-210ENST00000593024 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
UBXN6-210ENST00000593024 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.16■■□□□ 1.94
UBXN6-210ENST00000593024 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.15■■□□□ 1.94
UBXN6-210ENST00000593024 DISP1Q96F81 1524 aa27.15■■□□□ 1.94
UBXN6-210ENST00000593024 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
UBXN6-210ENST00000593024 SAMD9Q5K651 1589 aa27.14■■□□□ 1.93
UBXN6-210ENST00000593024 KIAA0556O60303 1618 aa27.12■■□□□ 1.93
UBXN6-210ENST00000593024 CEP162Q5TB80 1403 aa27.11■■□□□ 1.93
UBXN6-210ENST00000593024 CLIP1P30622 1438 aa27.1■■□□□ 1.93
UBXN6-210ENST00000593024 ARHGEF11O15085 1522 aa27.1■■□□□ 1.93
UBXN6-210ENST00000593024 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.09■■□□□ 1.93
UBXN6-210ENST00000593024 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.06■■□□□ 1.92
UBXN6-210ENST00000593024 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.03■■□□□ 1.92
UBXN6-210ENST00000593024 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.03■■□□□ 1.92
UBXN6-210ENST00000593024 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.03■■□□□ 1.92
UBXN6-210ENST00000593024 P3H3Q8IVL6 736 aa27.01■■□□□ 1.91
UBXN6-210ENST00000593024 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.98■■□□□ 1.91
UBXN6-210ENST00000593024 PTPRGP23470 1445 aa26.96■■□□□ 1.91
UBXN6-210ENST00000593024 ARAP1Q96P48 1450 aa26.93■■□□□ 1.9
UBXN6-210ENST00000593024 FMN1Q68DA7 1419 aa26.88■■□□□ 1.89
UBXN6-210ENST00000593024 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
UBXN6-210ENST00000593024 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.81■■□□□ 1.88
UBXN6-210ENST00000593024 UACAQ9BZF9 1416 aa26.8■■□□□ 1.88
UBXN6-210ENST00000593024 ABCA8O94911 1581 aa26.79■■□□□ 1.88
UBXN6-210ENST00000593024 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.78■■□□□ 1.88
UBXN6-210ENST00000593024 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.76■■□□□ 1.87
UBXN6-210ENST00000593024 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.76■■□□□ 1.87
UBXN6-210ENST00000593024 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.75■■□□□ 1.87
UBXN6-210ENST00000593024 ABCC2Q92887 1545 aa26.74■■□□□ 1.87
UBXN6-210ENST00000593024 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.73■■□□□ 1.87
UBXN6-210ENST00000593024 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.7■■□□□ 1.86
UBXN6-210ENST00000593024 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
UBXN6-210ENST00000593024 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.69■■□□□ 1.86
UBXN6-210ENST00000593024 HECW1Q76N89 1606 aa26.68■■□□□ 1.86
UBXN6-210ENST00000593024 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
UBXN6-210ENST00000593024 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
UBXN6-210ENST00000593024 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.61■■□□□ 1.85
UBXN6-210ENST00000593024 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
UBXN6-210ENST00000593024 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
UBXN6-210ENST00000593024 ATP10BO94823 1461 aa26.56■■□□□ 1.84
UBXN6-210ENST00000593024 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.56■■□□□ 1.84
UBXN6-210ENST00000593024 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
UBXN6-210ENST00000593024 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.53■■□□□ 1.84
UBXN6-210ENST00000593024 ARID3CA6NKF2 412 aa26.53■■□□□ 1.84
UBXN6-210ENST00000593024 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
UBXN6-210ENST00000593024 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
UBXN6-210ENST00000593024 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBXN6-210ENST00000593024 APLP2Q06481 763 aa26.47■■□□□ 1.83
UBXN6-210ENST00000593024 MAP3K1Q13233 1512 aa26.47■■□□□ 1.83
UBXN6-210ENST00000593024 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.45■■□□□ 1.82
UBXN6-210ENST00000593024 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
UBXN6-210ENST00000593024 TIAM1Q13009 1591 aa26.45■■□□□ 1.82
UBXN6-210ENST00000593024 MAPKBP1O60336 1514 aa26.44■■□□□ 1.82
UBXN6-210ENST00000593024 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-210ENST00000593024 ASXL2Q76L83 1435 aa26.4■■□□□ 1.82
UBXN6-210ENST00000593024 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.37■■□□□ 1.81
UBXN6-210ENST00000593024 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
UBXN6-210ENST00000593024 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.33■■□□□ 1.81
UBXN6-210ENST00000593024 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.33■■□□□ 1.81
UBXN6-210ENST00000593024 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.32■■□□□ 1.8
UBXN6-210ENST00000593024 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.31■■□□□ 1.8
UBXN6-210ENST00000593024 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
UBXN6-210ENST00000593024 KCNH8Q96L42 1107 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN6-210ENST00000593024 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN6-210ENST00000593024 KIF14Q15058 1648 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN6-210ENST00000593024 DIP2BQ9P265 1576 aa26.21■■□□□ 1.79
UBXN6-210ENST00000593024 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
UBXN6-210ENST00000593024 GLI2P10070 1586 aa26.2■■□□□ 1.78
UBXN6-210ENST00000593024 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.17■■□□□ 1.78
UBXN6-210ENST00000593024 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
UBXN6-210ENST00000593024 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.15■■□□□ 1.78
UBXN6-210ENST00000593024 NCOA2Q15596 1464 aa26.15■■□□□ 1.78
UBXN6-210ENST00000593024 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.14■■□□□ 1.77
UBXN6-210ENST00000593024 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.12■■□□□ 1.77
UBXN6-210ENST00000593024 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
UBXN6-210ENST00000593024 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.08■■□□□ 1.77
UBXN6-210ENST00000593024 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.07■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 CD109Q6YHK3 1445 aa26.06■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.05■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 PLCH2O75038 1416 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.02■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 PREX2Q70Z35 1606 aa26.02■■□□□ 1.76
UBXN6-210ENST00000593024 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.01■■□□□ 1.75
UBXN6-210ENST00000593024 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26■■□□□ 1.75
UBXN6-210ENST00000593024 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.98■■□□□ 1.75
UBXN6-210ENST00000593024 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms