RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578709.5

ERBB2-209, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 2, human

TSL 4

Gene ERBB2, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB2-209	ENST00000578709	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		39.64	■■■■□ 3.94
ERBB2-209	ENST00000578709	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		39.57	■■■■□ 3.93
ERBB2-209	ENST00000578709	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.56	■■■■□ 3.92
ERBB2-209	ENST00000578709	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	39.49	■■■■□ 3.91
ERBB2-209	ENST00000578709	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.45	■■■■□ 3.91
ERBB2-209	ENST00000578709	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.39	■■■■□ 3.9
ERBB2-209	ENST00000578709	IQGAP2	Q13576	1575 aa		39.37	■■■■□ 3.89
ERBB2-209	ENST00000578709	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.37	■■■■□ 3.89
ERBB2-209	ENST00000578709	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.36	■■■■□ 3.89
ERBB2-209	ENST00000578709	KIF21B	O75037	1637 aa		39.32	■■■■□ 3.89
ERBB2-209	ENST00000578709	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		39.3	■■■■□ 3.88
ERBB2-209	ENST00000578709	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.25	■■■■□ 3.87
ERBB2-209	ENST00000578709	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		39.19	■■■■□ 3.86
ERBB2-209	ENST00000578709	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		39.11	■■■■□ 3.85
ERBB2-209	ENST00000578709	GOLGA3	Q08378	1498 aa		39.09	■■■■□ 3.85
ERBB2-209	ENST00000578709	DISP1	Q96F81	1524 aa		39.09	■■■■□ 3.85
ERBB2-209	ENST00000578709	KIAA0556	O60303	1618 aa		39	■■■■□ 3.83
ERBB2-209	ENST00000578709	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		38.98	■■■■□ 3.83
ERBB2-209	ENST00000578709	PTPRG	P23470	1445 aa		38.92	■■■■□ 3.82
ERBB2-209	ENST00000578709	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	38.92	■■■■□ 3.82
ERBB2-209	ENST00000578709	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		38.92	■■■■□ 3.82
ERBB2-209	ENST00000578709	SAMD9	Q5K651	1589 aa		38.84	■■■■□ 3.81
ERBB2-209	ENST00000578709	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	38.75	■■■■□ 3.79
ERBB2-209	ENST00000578709	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		38.74	■■■■□ 3.79
ERBB2-209	ENST00000578709	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		38.72	■■■■□ 3.79
ERBB2-209	ENST00000578709	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	38.7	■■■■□ 3.79
ERBB2-209	ENST00000578709	UACA	Q9BZF9	1416 aa		38.68	■■■■□ 3.78
ERBB2-209	ENST00000578709	P3H3	Q8IVL6	736 aa		38.67	■■■■□ 3.78
ERBB2-209	ENST00000578709	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		38.66	■■■■□ 3.78
ERBB2-209	ENST00000578709	ABCC2	Q92887	1545 aa		38.62	■■■■□ 3.77
ERBB2-209	ENST00000578709	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		38.58	■■■■□ 3.77
ERBB2-209	ENST00000578709	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		38.57	■■■■□ 3.76
ERBB2-209	ENST00000578709	ABCA8	O94911	1581 aa		38.57	■■■■□ 3.76
ERBB2-209	ENST00000578709	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		38.54	■■■■□ 3.76
ERBB2-209	ENST00000578709	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	38.54	■■■■□ 3.76
ERBB2-209	ENST00000578709	MAPKBP1	O60336	1514 aa		38.47	■■■■□ 3.75
ERBB2-209	ENST00000578709	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		38.47	■■■■□ 3.75
ERBB2-209	ENST00000578709	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		38.43	■■■■□ 3.74
ERBB2-209	ENST00000578709	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		38.39	■■■■□ 3.74
ERBB2-209	ENST00000578709	CLIP1	P30622	1438 aa		38.38	■■■■□ 3.74
ERBB2-209	ENST00000578709	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	38.36	■■■■□ 3.73
ERBB2-209	ENST00000578709	FMN1	Q68DA7	1419 aa		38.34	■■■■□ 3.73
ERBB2-209	ENST00000578709	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	38.33	■■■■□ 3.73
ERBB2-209	ENST00000578709	CEP162	Q5TB80	1403 aa		38.29	■■■■□ 3.72
ERBB2-209	ENST00000578709	ASXL2	Q76L83	1435 aa		38.28	■■■■□ 3.72
ERBB2-209	ENST00000578709	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	38.28	■■■■□ 3.72
ERBB2-209	ENST00000578709	ATP10B	O94823	1461 aa		38.24	■■■■□ 3.71
ERBB2-209	ENST00000578709	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		38.24	■■■■□ 3.71
ERBB2-209	ENST00000578709	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		38.19	■■■■□ 3.7
ERBB2-209	ENST00000578709	DIP2B	Q9P265	1576 aa		38.18	■■■■□ 3.7
ERBB2-209	ENST00000578709	ARID3C	A6NKF2	412 aa		38.15	■■■■□ 3.7
ERBB2-209	ENST00000578709	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		38.13	■■■■□ 3.69
ERBB2-209	ENST00000578709	HECW1	Q76N89	1606 aa		38.12	■■■■□ 3.69
ERBB2-209	ENST00000578709	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		38.1	■■■■□ 3.69
ERBB2-209	ENST00000578709	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		38.08	■■■■□ 3.69
ERBB2-209	ENST00000578709	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	38.07	■■■■□ 3.68
ERBB2-209	ENST00000578709	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	38.05	■■■■□ 3.68
ERBB2-209	ENST00000578709	GLI2	P10070	1586 aa		38.05	■■■■□ 3.68
ERBB2-209	ENST00000578709	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	38.01	■■■■□ 3.68
ERBB2-209	ENST00000578709	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	38.01	■■■■□ 3.68
ERBB2-209	ENST00000578709	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		38.01	■■■■□ 3.67
ERBB2-209	ENST00000578709	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	38	■■■■□ 3.67
ERBB2-209	ENST00000578709	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	37.99	■■■■□ 3.67
ERBB2-209	ENST00000578709	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		37.94	■■■■□ 3.66
ERBB2-209	ENST00000578709	KCNH8	Q96L42	1107 aa		37.91	■■■■□ 3.66
ERBB2-209	ENST00000578709	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		37.9	■■■■□ 3.66
ERBB2-209	ENST00000578709	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		37.9	■■■■□ 3.66
ERBB2-209	ENST00000578709	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		37.87	■■■■□ 3.65
ERBB2-209	ENST00000578709	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		37.82	■■■■□ 3.64
ERBB2-209	ENST00000578709	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	37.82	■■■■□ 3.64
ERBB2-209	ENST00000578709	TSPOAP1	O95153	1857 aa		37.81	■■■■□ 3.64
ERBB2-209	ENST00000578709	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		37.8	■■■■□ 3.64
ERBB2-209	ENST00000578709	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		37.77	■■■■□ 3.64
ERBB2-209	ENST00000578709	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	37.77	■■■■□ 3.64
ERBB2-209	ENST00000578709	CD109	Q6YHK3	1445 aa		37.74	■■■■□ 3.63
ERBB2-209	ENST00000578709	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	37.73	■■■■□ 3.63
ERBB2-209	ENST00000578709	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		37.69	■■■■□ 3.62
ERBB2-209	ENST00000578709	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		37.66	■■■■□ 3.62
ERBB2-209	ENST00000578709	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	37.66	■■■■□ 3.62
ERBB2-209	ENST00000578709	KIF14	Q15058	1648 aa		37.61	■■■■□ 3.61
ERBB2-209	ENST00000578709	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		37.6	■■■■□ 3.61
ERBB2-209	ENST00000578709	TIAM1	Q13009	1591 aa		37.52	■■■■□ 3.6
ERBB2-209	ENST00000578709	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		37.5	■■■■□ 3.59
ERBB2-209	ENST00000578709	MAP3K1	Q13233	1512 aa		37.5	■■■■□ 3.59
ERBB2-209	ENST00000578709	KDM6B	O15054	1643 aa		37.47	■■■■□ 3.59
ERBB2-209	ENST00000578709	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		37.46	■■■■□ 3.59
ERBB2-209	ENST00000578709	PLCH2	O75038	1416 aa		37.45	■■■■□ 3.59
ERBB2-209	ENST00000578709	NEO1	Q92859	1461 aa		37.44	■■■■□ 3.58
ERBB2-209	ENST00000578709	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		37.43	■■■■□ 3.58
ERBB2-209	ENST00000578709	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		37.43	■■■■□ 3.58
ERBB2-209	ENST00000578709	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		37.42	■■■■□ 3.58
ERBB2-209	ENST00000578709	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	37.39	■■■■□ 3.58
ERBB2-209	ENST00000578709	FANCA	O15360	1455 aa		37.38	■■■■□ 3.57
ERBB2-209	ENST00000578709	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		37.36	■■■■□ 3.57
ERBB2-209	ENST00000578709	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		37.36	■■■■□ 3.57
ERBB2-209	ENST00000578709	PREX2	Q70Z35	1606 aa		37.31	■■■■□ 3.56
ERBB2-209	ENST00000578709	AKNA	Q7Z591	1439 aa		37.3	■■■■□ 3.56
ERBB2-209	ENST00000578709	APLP2	Q06481	763 aa		37.3	■■■■□ 3.56
ERBB2-209	ENST00000578709	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		37.3	■■■■□ 3.56
ERBB2-209	ENST00000578709	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		37.29	■■■■□ 3.56

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