RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576591.1

AKAP1-218, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene AKAP1, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-218ENST00000576591 SHROOM2Q13796 1616 aa24.46■■□□□ 1.51
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AKAP1-218ENST00000576591 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.4■■□□□ 1.5
AKAP1-218ENST00000576591 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.4■■□□□ 1.5
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AKAP1-218ENST00000576591 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.11■■□□□ 1.29
AKAP1-218ENST00000576591 APLP2Q06481 763 aa23.11■■□□□ 1.29
AKAP1-218ENST00000576591 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
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AKAP1-218ENST00000576591 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
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