RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571855.1

ABCC3-218, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

Gene ABCC3, Length 1,562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-218ENST00000571855 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.6■■■□□ 2.01
ABCC3-218ENST00000571855 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.6■■■□□ 2.01
ABCC3-218ENST00000571855 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.57■■■□□ 2
ABCC3-218ENST00000571855 SHROOM2Q13796 1616 aa27.55■■■□□ 2
ABCC3-218ENST00000571855 JPH4Q96JJ6 628 aa27.53■■■□□ 2
ABCC3-218ENST00000571855 IQGAP2Q13576 1575 aa27.45■■□□□ 1.98
ABCC3-218ENST00000571855 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.45■■□□□ 1.98
ABCC3-218ENST00000571855 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
ABCC3-218ENST00000571855 KIF21BO75037 1637 aa27.44■■□□□ 1.98
ABCC3-218ENST00000571855 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.43■■□□□ 1.98
ABCC3-218ENST00000571855 ARAP1Q96P48 1450 aa27.42■■□□□ 1.98
ABCC3-218ENST00000571855 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.39■■□□□ 1.97
ABCC3-218ENST00000571855 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.31■■□□□ 1.96
ABCC3-218ENST00000571855 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.29■■□□□ 1.96
ABCC3-218ENST00000571855 GOLGA3Q08378 1498 aa27.28■■□□□ 1.96
ABCC3-218ENST00000571855 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.27■■□□□ 1.96
ABCC3-218ENST00000571855 DISP1Q96F81 1524 aa27.24■■□□□ 1.95
ABCC3-218ENST00000571855 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
ABCC3-218ENST00000571855 KIAA0556O60303 1618 aa27.19■■□□□ 1.94
ABCC3-218ENST00000571855 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.17■■□□□ 1.94
ABCC3-218ENST00000571855 PTPRGP23470 1445 aa27.14■■□□□ 1.94
ABCC3-218ENST00000571855 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
ABCC3-218ENST00000571855 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
ABCC3-218ENST00000571855 SAMD9Q5K651 1589 aa27.08■■□□□ 1.93
ABCC3-218ENST00000571855 P3H3Q8IVL6 736 aa27.05■■□□□ 1.92
ABCC3-218ENST00000571855 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.99■■□□□ 1.91
ABCC3-218ENST00000571855 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.99■■□□□ 1.91
ABCC3-218ENST00000571855 UACAQ9BZF9 1416 aa26.96■■□□□ 1.91
ABCC3-218ENST00000571855 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.94■■□□□ 1.9
ABCC3-218ENST00000571855 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.93■■□□□ 1.9
ABCC3-218ENST00000571855 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.92■■□□□ 1.9
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ABCC3-218ENST00000571855 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.91■■□□□ 1.9
ABCC3-218ENST00000571855 ABCC2Q92887 1545 aa26.9■■□□□ 1.9
ABCC3-218ENST00000571855 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
ABCC3-218ENST00000571855 ABCA8O94911 1581 aa26.88■■□□□ 1.89
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ABCC3-218ENST00000571855 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.8■■□□□ 1.88
ABCC3-218ENST00000571855 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.78■■□□□ 1.88
ABCC3-218ENST00000571855 MAPKBP1O60336 1514 aa26.77■■□□□ 1.88
ABCC3-218ENST00000571855 FMN1Q68DA7 1419 aa26.75■■□□□ 1.87
ABCC3-218ENST00000571855 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ABCC3-218ENST00000571855 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
ABCC3-218ENST00000571855 CEP162Q5TB80 1403 aa26.74■■□□□ 1.87
ABCC3-218ENST00000571855 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ABCC3-218ENST00000571855 ARID3CA6NKF2 412 aa26.68■■□□□ 1.86
ABCC3-218ENST00000571855 ASXL2Q76L83 1435 aa26.68■■□□□ 1.86
ABCC3-218ENST00000571855 ATP10BO94823 1461 aa26.67■■□□□ 1.86
ABCC3-218ENST00000571855 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.62■■□□□ 1.85
ABCC3-218ENST00000571855 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.62■■□□□ 1.85
ABCC3-218ENST00000571855 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
ABCC3-218ENST00000571855 HECW1Q76N89 1606 aa26.59■■□□□ 1.85
ABCC3-218ENST00000571855 DIP2BQ9P265 1576 aa26.59■■□□□ 1.85
ABCC3-218ENST00000571855 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
ABCC3-218ENST00000571855 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.58■■□□□ 1.85
ABCC3-218ENST00000571855 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ABCC3-218ENST00000571855 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.57■■□□□ 1.84
ABCC3-218ENST00000571855 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.57■■□□□ 1.84
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ABCC3-218ENST00000571855 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.51■■□□□ 1.83
ABCC3-218ENST00000571855 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.5■■□□□ 1.83
ABCC3-218ENST00000571855 GLI2P10070 1586 aa26.49■■□□□ 1.83
ABCC3-218ENST00000571855 KCNH8Q96L42 1107 aa26.48■■□□□ 1.83
ABCC3-218ENST00000571855 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.46■■□□□ 1.83
ABCC3-218ENST00000571855 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.43■■□□□ 1.82
ABCC3-218ENST00000571855 TSPOAP1O95153 1857 aa26.41■■□□□ 1.82
ABCC3-218ENST00000571855 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.4■■□□□ 1.82
ABCC3-218ENST00000571855 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ABCC3-218ENST00000571855 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.38■■□□□ 1.81
ABCC3-218ENST00000571855 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.34■■□□□ 1.81
ABCC3-218ENST00000571855 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.32■■□□□ 1.8
ABCC3-218ENST00000571855 CD109Q6YHK3 1445 aa26.31■■□□□ 1.8
ABCC3-218ENST00000571855 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ABCC3-218ENST00000571855 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
ABCC3-218ENST00000571855 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.28■■□□□ 1.8
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ABCC3-218ENST00000571855 KIF14Q15058 1648 aa26.24■■□□□ 1.79
ABCC3-218ENST00000571855 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.22■■□□□ 1.79
ABCC3-218ENST00000571855 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.22■■□□□ 1.79
ABCC3-218ENST00000571855 TIAM1Q13009 1591 aa26.19■■□□□ 1.78
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ABCC3-218ENST00000571855 MAP3K1Q13233 1512 aa26.15■■□□□ 1.78
ABCC3-218ENST00000571855 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.13■■□□□ 1.77
ABCC3-218ENST00000571855 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.12■■□□□ 1.77
ABCC3-218ENST00000571855 PLCH2O75038 1416 aa26.11■■□□□ 1.77
ABCC3-218ENST00000571855 APLP2Q06481 763 aa26.11■■□□□ 1.77
ABCC3-218ENST00000571855 KDM6BO15054 1643 aa26.11■■□□□ 1.77
ABCC3-218ENST00000571855 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.09■■□□□ 1.77
ABCC3-218ENST00000571855 NEO1Q92859 1461 aa26.07■■□□□ 1.76
ABCC3-218ENST00000571855 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ABCC3-218ENST00000571855 FANCAO15360 1455 aa26.07■■□□□ 1.76
ABCC3-218ENST00000571855 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.06■■□□□ 1.76
ABCC3-218ENST00000571855 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
ABCC3-218ENST00000571855 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.06■■□□□ 1.76
ABCC3-218ENST00000571855 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.04■■□□□ 1.76
ABCC3-218ENST00000571855 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.04■■□□□ 1.76
ABCC3-218ENST00000571855 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.03■■□□□ 1.76
ABCC3-218ENST00000571855 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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